我正在使用rgdal
和raster
包处理R中的栅格数据。我想摆脱所有无限,没有值,负值并用零替换它们:
NoNA <- function (x) {
x[is.infinite(x) | is.na(x) | is.nan(x) | is.null(x) | is.na(x < 0)] <- 0
}
ndii_noNA <- calc(ndii, NoNA)
然后ndii_noNA
只有一个值0.我试过if else语句但是它会引发错误
.calcTest(x[1:5], fun, na.rm, forcefun, forceapply).
有什么方法可以解决这个问题吗?
答案 0 :(得分:1)
你非常接近,但犯了两个错误:
which()
的索引中使用x
,而不仅仅是真实陈述。否则,您将索引x[TRUE]
或x[FALSE]
,这不是您想要的。 which()
将返回向量中所有“坏”元素的索引。<-
进行作业时,x
的本地副本将被更改,而不是已通过的副本。如果您想更改x
,则需要使用<<-
。也就是说,坚持使用R的功能范例是明智的,在这种范例中,您将对本地副本进行更改,然后使用return(x)
返回,而不是更改。这是你想要的功能:
# The "change in place" method (may be considered bad style)
NoNA <- function(x) {
x[which(is.infinite(x) | is.na(x) | is.nan(x) | is.null(x) | is.na(x < 0))] <<- 0
}
# The functional way (recommended)
NoNA <- function(x) {
x[which(is.infinite(x) | is.na(x) | is.nan(x) | is.null(x) | is.na(x < 0))] <- 0
return(x)
}
答案 1 :(得分:0)
编辑:ifelse()更干净但@ cgmil的答案确实更快。
x = rep(c(Inf, -Inf, NULL, NaN, NA, 1), 250e3)
no_na = function(x){
ifelse(
is.infinite(x) | is.na(x) | is.nan(x) | is.null(x) | is.na(x < 0), 0, x
)
}
NoNA <- function(x) {
x[which(is.infinite(x) | is.na(x) | is.nan(x) | is.null(x) | is.na(x < 0))] <- 0
return(x)
}
microbenchmark(
no_na(x), NoNA(x),
times = 50
)
# Unit: milliseconds
# expr min lq mean median uq max neval
# no_na(x) 380.9375 399.7520 416.7729 424.5490 429.6005 451.0534 50
# NoNA(x) 242.8555 249.0034 255.8857 251.3694 254.8176 285.1451 50