如何用ggplot2绘制二项式可变百分比条形图

Question

我正在绘制以下脚本中名为“aborted”的二项式变量（0/1）：

`ggplot(sab2, aes(x=locality,fill=factor(aborted))) + geom_bar() + scale_fill_manual() + scale_fill_grey(labels = c("aborted","alive")) + xlab("") + ylab("N empty fruits per plant") + guides(fill=guide_legend(title="Fruits vitality")) + facet_grid(~year) + theme_bw() + theme(legend.position = "bottom",  panel.background = element_rect(fill = "white"), panel.grid.major = element_line(colour = "white"),  axis.text.x=element_text(angle=90,hjust=1,vjust=0.5))`    

这就是结果：

如果我只想绘制中止的百分比（“中止”因子的“0”级别），我可以在代码中更改什么？ 我可以获得类似于以下的情节（但有中止的百分比）：

谢谢你！

Answer 1

使用stat_summary计算aborted的平均值，这只是aborted取值为0或1时中止的百分比。然后您还可以使用stat_summary使用mean_cl_boot获得自举95％置信区间。这是假数据的一个例子：

library(scales)

set.seed(389)
sab2 = data.frame(locality=rep(1:6,each=100), aborted=sample(0:1, 600, replace=TRUE))

ggplot(sab2, aes(factor(locality), aborted)) +
  stat_summary(fun.y=mean, geom="bar", fill="grey70") +
  stat_summary(fun.data=mean_cl_boot, geom="errorbar", width=0.2) +
  scale_y_continuous(labels=percent_format(), limits=c(0,1)) +
  theme_bw()

点数可能比这里的条形图更好：

ggplot(sab2, aes(factor(locality), aborted)) +
  stat_summary(fun.data=mean_cl_boot, geom="errorbar", width=0.2) +
  stat_summary(fun.y=mean, geom="point", shape=21, fill="red", size=2) +
  scale_y_continuous(labels=percent_format(), limits=c(0,1)) +
  theme_bw()

或使用百分比值作为点标记：

ggplot(sab2, aes(factor(locality), aborted)) +
  stat_summary(fun.data=mean_cl_boot, geom="errorbar", width=0.2, colour="grey60") +
  stat_summary(fun.y=mean, geom="text", size=3, colour="red",
               aes(label=paste0(sprintf("%1.1f", ..y..*100),"%"))) +
  scale_y_continuous(labels=percent_format(), limits=c(0,1)) +
  theme_bw()