Question

我正在尝试提取专栏＆＃34; m＆＃34;从多个txt文件（file1.txt，file2.txt ,,,等）并将每列转置到新文件中的一行。

以下是$CAML = "<Where> <Eq> <FieldRef Name='Period' /> <Value Type='Text'>$($month)</Value> </Eq> </Where>"：

file1.txt

我希望有一个contig_1 contig_1 geneX ctg1_886;ctg1_887;ctg1_888 contig_2 contig_2 geneY ctg1_886;ctg1_887;ctg1_888 contig_3 contig_3 genesZ ctg1_886;ctg1_887;ctg1_888文件，如下所示：

summary.txt

总行数可能因文件而异。我尝试使用file1 geneX geneY geneZ file2 geneA geneY . . . etc.但没有成功。

Answer 1

根据评论中的glenn jackmans建议，GNU AWK解决方案将如下所示：

awk 'BEGIN {ORS=" "} BEGINFILE{print FILENAME} {print $3} ENDFILE{ printf("\n")}'  file*.txt

awk解决方案可能看起来像这样（对不起只有gnu awk进行测试）：

awk 'BEGIN {ORS=" "} FNR==1 {printf("\n%s", FILENAME)} {print $3} END{printf("\n")} '

<强>解释

有几种特殊模式：

BEGIN，其动作在开头执行一次。这里ORS（输出记录分隔符）设置为空格，效果是从每个原始行获取一个新列，此是转置步骤
END操作最后执行一次
BEGINFILE和ENDFILE操作在每个文件的处理开始和结束时执行一次。这里分别打印FILENAME换行符。

Answer 2

假设字段分隔符是多个空格：

for f in file*.txt ; do 
    echo $f `tr -s ' ' < $f | cut -d ' ' -f 3`
done > summary.txt

如果数据分开<tab>：

for f in file*.txt ; do 
    echo $f `cut -f 3 $f`
done > summary.txt

提取列＆＃39; x＆＃39;来自多个文件，并使用＆＃39; x＆＃39;转置文件名。

2 个答案: