Linux v.s上的基准cp + git Windows：为何如此差异？

Question

我使用这个Python script创建了大量文件，主要用于对Git进行基准测试。

结果非常令人惊讶，尤其是Windows和Linux之间的差异。

基本上我的脚本会创建12个目录，每个目录中包含512个文件。每个文件大约2到4 kB。使用Git对象，存储库大约是12k个文件。

我做了基准测试：

1. 是时候将所有文件添加到git git add .
了
2. 结帐前一个分支的时间
3. 在同一个SSD上复制存储库的时间
4. 将存储库复制到外部Sata HDD（NTFS）的时间

我使用Windows 10和Linux上的相同存储库执行此操作：

 Operation               Linux     Windows    Ratio
 ---------               -----     -------    -----
 1. git add .            0.47s      21.7s      x46
 2. git checkout HEAD~1  0.35s      16.2s      x46 
 3. git checkout .       0.40s      20.5s      x50
 4. cp -r ssd->ssd       0.35s      1m14s      x211
 5. cp -r ssd->hdd       4.90s      6m25s      x78 

操作按此顺序完成：

$ mkdir test
$ cp test.py test && cd test
$ ./test.py # Creation of the files
$ git init
$ time git add .               # (1)
$ git commit -qam 1
$ ./test.py # Alter some files
$ commit -qam 2

$ cd ..
$ time cp -r test /media/hdd/  # (4)
$ time cp -r test test2        # (5)
$ cd test

$ time git checkout HEAD~1     # (2)
$ ./test.py 
$ git checkout master
$ git reset --soft head~1
$ time git checkout .          # (3)

基准测试是在同一台PC上完成的（使用双启动）。

为什么会有这样的差异？我无法相信。