Question

我有一个2列的tsv，我需要使用第2列中的部分值插入新的第一列。

我有什么：

fastq/D0110.L001_R1_001.fastq  fastq/D0110.L001_R2_001.fastq
fastq/D0206.L001_R1_001.fastq  fastq/D0206.L001_R2_001.fastq
fastq/D0208.L001_R1_001.fastq  fastq/D0208.L001_R2_001.fastq

我想要的是什么：

D0110    fastq/D0110.L001_R1_001.fastq  fastq/D0110.L001_R2_001.fastq
D0206    fastq/D0206.L001_R1_001.fastq  fastq/D0206.L001_R2_001.fastq
D0208    fastq/D0208.L001_R1_001.fastq  fastq/D0208.L001_R2_001.fastq

我想把所有东西都拉到＆＃34; fastq /＆＃34;和第一个时期并打印出新的第一列。

Answer 1

$ awk -F'[/.]' '{printf "%s\t%s\n",$2,$0}' file
D0110   fastq/D0110.L001_R1_001.fastq   fastq/D0110.L001_R2_001.fastq
D0206   fastq/D0206.L001_R1_001.fastq   fastq/D0206.L001_R2_001.fastq
D0208   fastq/D0208.L001_R1_001.fastq   fastq/D0208.L001_R2_001.fastq

如何运作

awk隐式循环遍历所有输入行。

-F'[/.]'

这告诉awk使用任何/或.作为字段分隔符。这意味着，对于您的输入，您要查找的字符串将是第二个字段。
printf "%s\t%s\n",$2,$0

这告诉awk打印第二个字段（$2），然后是选项卡（\t），后跟输入行（$0），后跟换行符（ \n）

gawk基于第二列的一部分创建第一列

1 个答案:

如何运作