Question

我正在尝试从Cython链接到我自己的C库，按照我在网上找到的指示，包括这个答案：

Using Cython To Link Python To A Shared Library

我正在通过Spyder运行IPython。

我的setup.py看起来像这样：

libMyLib.so

文件/path/to/lib位于try: os.environ["LD_LIBRARY_PATH"] += ":/path/to/lib" except KeyError: os.environ["LD_LIBRARY_PATH"] = "/path/to/lib"，编译正常。

我的IPython配置文件启动文件夹中有一个Python脚本，用于执行此操作

os.environ["LD_LIBRARY_PATH"]

我可以确认这是在运行，因为如果我在IPython解释器中输入/path/to/lib，它会返回import mycythonmodule

但是当我尝试加载Cython模块（即ImportError: libMyLib.so: cannot open shared object file: No such file or directory）时，我得到：

/usr/lib

我也尝试将libMyLib.so放在其他地方，看看cython是否会找到它：

在运行Python的目录中
在Python路径上
与cython模块相同的文件夹

但它仍然找不到共享库。我能找到它的唯一方法是将它放在$a->menu_order中，但我不希望它在那里，我希望能够设置库路径。

我错过了什么吗？

Answer 1

我是自我回答，以防其他人遇到同样的问题。看起来答案在这里：

Set LD_LIBRARY_PATH before importing in python

Changing LD_LIBRARY_PATH at runtime for ctypes

根据这些答案（以及我的经验），链接器在启动python时读取LD_LIBRARY_PATH，因此从python中更改它没有任何有用的效果，至少不是我希望的效果。唯一的解决方案是在设置LD_LIBRARY_PATH的shell脚本中包装python，或者在链接器搜索路径的某处删除共享对象。

有点痛，但它就是它。

Answer 2

我已通过更改setup.py对其进行了修复。

我有一个名为“ libtmsmdreader.so”的C ++动态共享库。和一个名为“ TmsMdReader.hpp”的头文件
我将C ++共享库包装到名为“ tmsmdreader-pythonxxxxxx.so”的cython库中。

from setuptools import setup 
from distutils.extension import Extension
from Cython.Build import cythonize

setup(
    name="tmsmdreader",
    ext_modules=cythonize([
        Extension(
            name="tmsmdreader",
            language="c++",
            sources=["TmsMdReaderApi.pyx"],
            libraries=["tmsmdreader"],
            library_dirs=["."],
            include_dirs=["."],
            extra_compile_args=["-std=c++14"],
            compiler_directives={'language_level': 3},
            runtime_library_dirs=["."])
            ]))

library_dirs = [“。”]和runtime_library_dirs = [“。”]可以修复python scripy目录中的libtmsmdreader.so的LD_LIBRARY_PATH

Cython无法找到共享对象文件

2 个答案: