Question

通常在Burrows-Wheeler Transform算法中，$字符用于表示字符串的结尾，但在很多情况下，$ $被省略。

我想知道在不知道最后一个角色的位置的情况下它是如何反转的？

例如，我有这个BWT：

[[[[[1- [[11endgnad1234245ndbnbbb]]]]]]] nnnngnabbbdiaaaiaaii

遵循该算法，我可以轻松构建BWT矩阵的第一列，我选择以压缩方式表示，如下所示：

Character : Occurrences
1         : 4
2         : 2
3         : 1
4         : 2
5         : 1
[         : 7
]         : 7
a         : 7
b         : 7
d         : 4
e         : 1
g         : 2
i         : 4
n         : 9

在不知道哪个字符是原始字符串中的最后一个字符的情况下，我无法看到如何重建原始字符串。

非常感谢任何帮助。升

P / S：如果您想知道原始字符串是什么：

[1]禁止[2]香蕉[3]频带[4]绷带[12]箱[14]结合[15]结合

Answer 1

你不能（但你可以尝试;-)。您的第一个bwt符号是原始字符串中的最后一个＆＃39; S＆＃39;。现在，您应该通过LF映射向后展开原始字符串。它实际上是bin [sym] + rank（sym，i）+ 1，你从i = 0开始。您可以从出现中轻松获取bin []数组。问题是，一旦你的'我'＆＃39;更大然后省略＆＃39; $＆＃39;你不应该在最后添加1＆＃39; 1＆＃39;所以你打破了字符串，事情变得讨厌。如果您还重建sa []并覆盖已设置的索引，则可以检测到错误。因此，您可以将任意$位置设置为＆＃39; 0＆＃39; 0并尝试恢复，然后如果失败将其设置为1 ...直到您正确重建。不知道这是否可以优化。

干杯，

d

反向BWT，不知道最后一个字符

1 个答案: