为什么以下情节看起来有所不同?两种方法似乎都使用高斯内核。
ggplot2
如何计算密度?
library(fueleconomy)
d <- density(vehicles$cty, n=2000)
ggplot(NULL, aes(x=d$x, y=d$y)) + geom_line() + scale_x_log10()
ggplot(vehicles, aes(x=cty)) + geom_density() + scale_x_log10()
更新
此问题的解决方案已经出现在SO here上,但ggplot2传递给R stats密度函数的具体参数仍然不清楚。
另一种解决方案是直接从ggplot2图中提取密度数据,如图here所示
答案 0 :(得分:3)
在这种情况下,不是密度计算不同而是如何 应用log10转换。
首先检查密度是否相似而不进行变换
library(ggplot2)
library(fueleconomy)
d <- density(vehicles$cty, from=min(vehicles$cty), to=max(vehicles$cty))
ggplot(data.frame(x=d$x, y=d$y), aes(x=x, y=y)) + geom_line()
ggplot(vehicles, aes(x=cty)) + stat_density(geom="line")
所以问题似乎是变革。在下面的stat_density
中,似乎是
如果在密度计算之前将log10变换应用于x变量。
因此,要手动重现结果,您必须先转换变量
计算密度。例如
d2 <- density(log10(vehicles$cty), from=min(log10(vehicles$cty)),
to=max(log10(vehicles$cty)))
ggplot(data.frame(x=d2$x, y=d2$y), aes(x=x, y=y)) + geom_line()
ggplot(vehicles, aes(x=cty)) + stat_density(geom="line") + scale_x_log10()
PS:要了解ggplot
如何为密度准备数据,您可以查看代码as.list(StatDensity)
导致StatDensity$compute_group
到ggplot2:::compute_density