运行Java应用程序的第一个实例中的Rserve（）错误

Question

我正在IntelliJ IDE中编写Java应用程序。该应用程序使用Rserve()连接到R并访问脚本。我有一个java脚本，它向shell发送命令以启动Rserve()。我现在面临的问题是我第一次运行应用程序时出现以下错误：

Exception in thread "main" java.lang.NoSuchMethodError: org.rosuda.REngine.REngineException.<init>(Lorg/rosuda/REngine/REngine;Ljava/lang/String;Ljava/lang/Throwable;)V
    at org.rosuda.REngine.Rserve.RserveException.<init>(RserveException.java:59)
    at org.rosuda.REngine.Rserve.RConnection.<init>(RConnection.java:90)
    at org.rosuda.REngine.Rserve.RConnection.<init>(RConnection.java:60)
    at org.rosuda.REngine.Rserve.RConnection.<init>(RConnection.java:44)
    at de.uni_jena.bioinformatik.RecalibrationGUI.Application.main(Application.java:40)
    at sun.reflect.NativeMethodAccessorImpl.invoke0(Native Method)
    at sun.reflect.NativeMethodAccessorImpl.invoke(NativeMethodAccessorImpl.java:62)
    at sun.reflect.DelegatingMethodAccessorImpl.invoke(DelegatingMethodAccessorImpl.java:43)
    at java.lang.reflect.Method.invoke(Method.java:497)
    at com.intellij.rt.execution.application.AppMain.main(AppMain.java:144)

而且，当我下次运行应用程序时，它完美运行。根据我的理解，在第一次运行中，它刚刚建立了Rserve()连接，然后在第二次运行中它起作用。有人可以帮我解决这个问题，以便应用程序在第一个实例中连接到Rserve()并且运行得很好吗？

这是调用Rserve()

的java类

public class InvokeRserve {
    public static boolean invoke() {
        try {
            Process p = Runtime.getRuntime().exec("R CMD Rserve --vanilla");

            BufferedReader stdInput = new BufferedReader(new InputStreamReader(p.getInputStream()));

            BufferedReader stdError = new BufferedReader(new InputStreamReader(p.getErrorStream()));
        }
        catch (IOException e) {
            System.out.println("Rserve connection: Exception occurred: ");
            e.printStackTrace();
            System.exit(-1);
        }
        return true;
    }
}

并且，这是启动应用程序并调用invoke()方法的主java类：

public class Application {
    /**
     * Main method for the Swing application
     *
     * @param args
     * @throws Exception
     */
    public static void main(String[] args) throws Exception {
            boolean value = InvokeRserve.invoke();
        RConnection check = new RConnection();
        if(check.isConnected())
        {
            // Run the GUI construction in the Event-Dispatching thread for thread-safety
            SwingUtilities.invokeLater(new Runnable() {

                /**
                 * run method which create a new GUIMain object
                 */
                @Override
                public void run() {new GUIMain("Java Application"); // Let the constructor do the job
                }
            });
       }
        else
        System.out.println("There was no R connection found.");
    }
}

此外，有没有办法停止现有的Rserve()连接（我读了不同的答案，建议使用shutdown()，但它不适用于我）？每次，我都必须重新启动计算机以关闭现有连接并启动新连接以测试上述代码。

我还查看了http://www.rforge.net/DATRAS/files/org/rosuda/Mondrian/StartRserve.java处的StartRserve.java示例文件。但是当我在我的应用程序的主类中使用方法StartRserve.checkLocalRserve()时，我得到了与上面显示的相同的Rserve()错误。

Answer 1

您的invoke()方法在实际启动Rserve之前返回，因此您显然尝试过早连接。您可能想要添加p.waitFor();。另请参阅StartRserve类，它在从Java启动Rserve时更加强大。

PS：我建议将stats-rosuda-devel mailing list用于Rserve问题，这样可以更快地得到答案。

Answer 2

我有一个解决方案，可以在不关闭计算机的情况下关闭Rserve连接。打开Rconnection时尝试这个：

    RConnection rconn=null;
    try{
        rconn=new RConnection();
        //Your personal code here

    } catch(Exception exc){
        exc.printStackTrace(out);
    } finally{
        if (rconn!=null){
            rconn.close();
        }
    }

这样当应用程序因异常中途停止时，它仍会运行finally部分并关闭连接。 希望这有助于及时。

对于异常部分的详细信息，如果您可以在代码旁边显示行号，则可以回答，因为异常日志是指行号代码。