我正在学习python-igraph,并且难以处理分成组件(它们之间没有连接)的图形。当我在此图上应用其中一个聚类算法时,它似乎无法正常工作,因此我需要将算法分别应用于每个子图(组件)。所以为了保持顶点的识别,我想添加一个顶点属性,它给出了原始图中的id号。我的图表是从weighted adjacency矩阵构建的:
import numpy as np
import igraph
def symmetrize(a):
return a + a.T - 2*np.diag(a.diagonal())
A = symmetrize(np.random.random((100,100)))
G = igraph.Graph.Adjacency(A.tolist(),attr="weight",mode="UPPER")
我发现应该有办法添加vertex attributes,但我不明白如何使用它。
答案 0 :(得分:4)
向所有顶点添加顶点属性的方式如下:
G.vs["attr"] = ["id1", "id2", "id3", ...]
您还可以将顶点属性附加到单个顶点:
G.vs[2]["attr"] = "id3"
例如,如果您只需要所有顶点的唯一标识符,则可以执行以下操作:
G.vs["original_id"] = list(range(G.vcount()))
(如果你在Python 2.x上,则不需要list()
部分,因为range()
已生成一个列表。)