无法使管道操作员正常运行 - linux

Question

我试图获取文件的第二列，获取前10个结果并按字母数字顺序排序，但它似乎无法正常工作。

cut -f2 file.txt | head -10 | sort -d

我得到了这个输出：

NM_000242
NM_000525
NM_001005850
NM_001136557
NM_001204426
NM_001204836
NM_001271762
NM_001287216
NM_006952
NM_007253

如果我先对文件进行排序并获取已排序文件的前10行

cut -f2 refGene.txt | sort -d | head -10

我得到了这个输出：

NM_000014
NM_000015
NM_000016
NM_000017
NM_000018
NM_000019
NM_000020
NM_000021
NM_000022
NM_000023

我不想对文件进行排序并获得排序结果，我想先获得前10行，然后按照字母数字顺序对它们进行排序。我在这里想念的是什么？ 感谢

Answer 1

嗯，它正常工作NM_000525在NM_001005850之前，后者在NM_00695之前。

但如果您需要在数字上对第二部分（_之后）进行排序，那么您可以这样做：

cut -f2 file.txt | head -10 | sort -t_ -k1,1 | sort -s -t_ -k2 -n

• -s是一种稳定的排序

假设整个文件中的格式相同（两个字母_个数字）

编辑：更短的版本将是：

cut -f2 file.txt | head -10 | sort -t_ -k1,1 -k2n

说明：

• -t_使用_作为字段的分隔符（用于选择要排序的字段）
• -k1,1从第一个字段开始按字母顺序排序（没有,1它也会排序第二个字段）
• -k2n在第二个字段上按数字排序

首先它将按第一个字段排序（使用字母数字排序），然后使用第二个字段（使用数字，因此它会将字符串转换为数字并对其进行排序）