这是我为连续多次重复写入多个文件通道而编写的代码。
文件生成,没有错误,但没有写入任何内容。 重要的部分是写入缓冲区的位置:" listofChan [j] .write(buff);" 。为什么这不起作用?
viewcontroller
好的,我找到了解决方案:
我需要在 FileChannel[] listofChan = new FileChannel[mStackHeight];
FileOutputStream[] outputFiles = new FileOutputStream[mStackHeight];
ByteBuffer buff = ByteBuffer.allocate(mStackWidth * 2); //2 byte integers
ShortBuffer SB = buff.asShortBuffer();
ImageProcessor ip;
try {
for (int i = 0; i < mStackHeight; i++) {
outputFiles[i] = new FileOutputStream(new File(mSavepath + "\\T_" + i + ".dat"), true);
listofChan[i] = outputFiles[i].getChannel();
}
System.out.println("File streams created successfully.");
for (int z = 0; z < mStackSz; z++) { //all slices in stack
ip = mStack.getProcessor(z + 1);
ip = ip.convertToShortProcessor();
short[] Pixels = (short[]) ip.getPixels();
for (int j = 0; j < mStackHeight; j++) { //all lines in one frame
SB.clear();
SB.put(Pixels, j * mStackWidth, mStackWidth);
listofChan[j].write(buff);
}
System.out.println("line " + z + " " + listofChan[mStackWidth-1].position());
// System.out.println("Image line : " z-1+ p/mStackWidth );
}
for (int i = 0; i < mStackHeight; i++) {
outputFiles[i].close();
}
System.out.println("Buffer contents written to file.");
} catch (IOException e) {
System.out.println("File IO exception : " + e.toString());
}
上方的一行上添加buff.clear()
因为在写SB.clear();
之后,读/写邮件位于缓冲区的末尾,因此无法进一步写入。同样适用于ByteBuffer
,这也需要单独重置,因为两个视图的位置都是独立的(我假设......)。
答案 0 :(得分:1)
我认为你需要在写入之前翻转你的字节缓冲区。它仍处于读/放模式。
答案 1 :(得分:0)
您不需要进行如此低级别的编程来完成任务。 ImageJ中已有工具可将每个通道保存到单独的文件中。
例如,您可以选择插件&gt;生物形式&gt; Bio-Formats Exporter (此插件包含在斐济),它将显示以下对话框:
您可以使用Recorder获取所需的Java代码:
IJ.run(imp, "Bio-Formats Exporter", "save=C:\\Path\\To\\Your\\File.ome.tif write_each_channel compression=Uncompressed");
如果您真的想与较低级别的导出器进行互动,请查看source code of Exporter.java
。