Question

我被分配了一项任务，用于从原始质谱分析光度数据（file.mzML）处理的文件中检索信息。这些文件只有＆＃34; .data＆＃34;作为扩展，当我打开它们时，我无法识别语言，因此我无法将它们加载到R中并对它们进行处理。

扩展名为.data的文件包含在此文件夹中：

ftp://ftp.pride.ebi.ac.uk/pride/data/archive/2015/11/PXD000299/

有人可以查看任何files.data并告诉我语言是否在（例如F010439）？

编辑：这些是一些片段

第1至10行

MIME-Version: 1.0 (Generated by Mascot version 1.0)
Content-Type: multipart/mixed; boundary=gc0p4Jq0M2Yt08jU534c0p

--gc0p4Jq0M2Yt08jU534c0p
Content-Type: application/x-Mascot; name="parameters"

LICENSE=Licensed to: INRA Tours, P-F Proteomique Analytique & Fonction.,Nouzilly (0085-0000003524/1), (2 processors).
MP=
NM=
COM=

第120至130行

NeutralLoss3_master=63.998285
--gc0p4Jq0M2Yt08jU534c0p
Content-Type: application/x-Mascot; name="unimod"

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8" ?>
<umod:unimod xmlns:umod="http://www.unimod.org/xmlns/schema/unimod_2" majorVersion="2" minorVersion="0" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xsi:schemaLocation="http://www.unimod.org/xmlns/schema/unimod_2 unimod_2.xsd">
  <umod:elements>
    <umod:elem avge_mass="1.00794" full_name="Hydrogen" mono_mass="1.007825035" title="H"/>
    <umod:elem avge_mass="2.014101779" full_name="Deuterium" mono_mass="2.014101779" title="2H"/>
    <umod:elem avge_mass="6.941" full_name="Lithium" mono_mass="7.016003" title="Li"/>
    <umod:elem avge_mass="12.0107" full_name="Carbon" mono_mass="12" title="C"/>

Answer 1

看起来该文件是MIME编码的“多部分”文件，其中包含（至少）两个组件文件。

您可以使用MIME解码器解码多部分。

第一个组件文件看起来像一个简单的“name = value”属性文件

第二个组件文件是XML。

我不知道这是否相关，但搜索Mascot file format给了我这个参考页面：

http://www.matrixscience.com/help/data_file_help.html

此外，当我搜索parser "x-mascot"和parser mascot时，有一些有趣的点击。如果您可以找到现有的解析器，那么您可以节省自己的实施工作。

这个文件由Mascot 1.0版生成的语言是什么语言？

1 个答案: