我已经在我的系统中安装了 embassy-phylipnew 。我正在弄清楚如何在python中使用它。糟糕的是,我找不到任何文件。
有谁知道如何使用它?我试图用它在命令行中执行Phylip的dnadist和邻居。
答案 0 :(得分:1)
有文件:
http://emboss.sourceforge.net/apps/cvs/embassy/phylipnew/
如果你想在python中使用它,你必须使用像subprocess模块这样的命令行界面。使用Biopython可以使用fneighbor
处的代码轻松阅读Bio.Phylo
输出格式(Newick)。