如何在Python中使用Embassy-Phylipnew

时间:2016-04-15 03:51:24

标签: biopython

我已经在我的系统中安装了 embassy-phylipnew 。我正在弄清楚如何在python中使用它。糟糕的是,我找不到任何文件。

有谁知道如何使用它?我试图用它在命令行中执行Phylip的dnadist和邻居。

1 个答案:

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有文件:

http://emboss.sourceforge.net/apps/cvs/embassy/phylipnew/

如果你想在python中使用它,你必须使用像subprocess模块这样的命令行界面。使用Biopython可以使用fneighbor处的代码轻松阅读Bio.Phylo输出格式(Newick)。