从bash传递参数到Python脚本

Question

我非常不熟悉Python，我试图从bsPlugins运行以下Python脚本： https://github.com/bbcf/bsPlugins/blob/master/bsPlugins/FileConvert.py
我下载了Python 2.7，所需的模块（biopython，bioscripts，bbcflib，bsPlugins），现在可以在bash中运行：

python FileConvert.py

没有任何错误消息。我现在正在努力将参数传递给脚本。我在源代码中看到了opt变量，但我对如何提供它们一无所知，或者至少得到有关预期语法的信息。

Answer 1

在python中接受命令行参数的一种简单方法是使用sys模块，如下所示：

import sys
print str(sys.argv)

因此，当您在终端中运行python FileConvert.py arg1 arg2 arg3时，您将获得输出：

['FileConvert.py', 'arg1', 'arg2', 'arg3']

永远记住，argv是一个字符串列表，而argv[0]包含第一个参数，即file name而不是arg1。

希望这能回答你的问题：）