从数据库中获取数据时连接丢失

Question

我有一个从mysql服务器获取数据的函数。我这样使用这样的公式：

sql <- sprintf("SELECT * FROM `match_player` INNER JOIN `match` ON match_player.match_id=match.id")
df_all <- dbGetQuery(con, sql)

一切正常。但是，我必须执行超过+/- 200.000行的计算，并且对于每个行，我必须从数据库中获取数据。在+/- 100.000记录之后，我收到错误导致连接丢失：

  

.local（conn，statement，...）出错：无法运行语句：   查询期间与MySQL服务器的连接丢失

关于如何确保我不会失去连接的任何想法

Answer 1

延迟，但也许有用：这看起来像是最近DBI和RMySQL版本中的已知回归，可能通过降级来修复：https://github.com/rstats-db/RMySQL/issues/190