使用numpy数组和元组保持每个元素一个占用的快速方法

时间:2016-04-09 14:00:40

标签: python arrays numpy

关于Stack的第一个问题,大家好!

我有一个元组,有两个1D np矩阵,来自np.nonzero,例如:

(array([479, 479, 479, 480, 480, 480, 481, 481, 481, 482, 482, 482, 650, 650, 650, 651, 651, 651, 652, 652, 652, 653, 653, 653, 654, 654, 654, 708, 708, 708, 709, 709, 709, 710, 710, 710, 711, 711, 711, 712, 712, 712, 713, 713, 713], dtype=int64), array([ 859, 860, 861, 859, 860, 861, 859, 860, 861, 859, 860, 861, 1045, 1046, 1047, 1045, 1046, 1047, 1045, 1046, 1047, 1045, 1046, 1047, 1045, 1046, 1047, 1039, 1040, 1041, 1039, 1040, 1041, 1039, 1040, 1041, 1039, 1040, 1041, 1039, 1040, 1041, 1039, 1040, 1041], dtype=int64))

但在我未来的使用中,这个元组会更大。我正在寻找最快的方法,只保留元组第一列中每个元素(第一个)的一个占用,并保持第二列中的第二个coordonate。另外,第一列已分类

对于我的例子,我想要这个输出:

(array([479, 480, 481, 482, 650, 651, 652, 653, 654, 708, 709, 710, 711, 712], dtype=int64), array([861, 861, 861, 861, 1047, 1047, 1047, 1047, 1047, 1041, 1041, 1041, 1041, 1041],dtype=int64))

一个天真的解决方案可能是:

for k in range(len(nozero[0])-1):
    i = nozero[0][k]
    i2 = nozero[0][k+1]
    j = nozero[1][k]
    j2 = nozero[1][k+1]

if  i != i2:
    x.append(i)
    y.append(j)

随时向我推荐一些有关此内容的信息,如果您有更好的想法来组织数据,请随时向我推荐! (或者如果你想要更好的解释)。

非常感谢!

2 个答案:

答案 0 :(得分:1)

您可以在第一个阵列上使用np.diff来查找所有首次出现的掩码。然后使用掩码简单地切割每个数组。

请注意,np.diff会产生一个比原始数字小1的数组,因此我们预先添加1(数组中的第一个元素始终是同类中的第一个)。

from numpy import array,int64
import numpy as np
arr1, arr2 = (array([479, 479, 479, 480, 480, 480, 481, 481, 481, 482, 482, 482, 650,
       650, 650, 651, 651, 651, 652, 652, 652, 653, 653, 653, 654, 654,
       654, 708, 708, 708, 709, 709, 709, 710, 710, 710, 711, 711, 711,
       712, 712, 712, 713, 713, 713], dtype=int64),
array([ 859,  860,  861,  859,  860,  861,  859,  860,  861,  859,  860,
        861, 1045, 1046, 1047, 1045, 1046, 1047, 1045, 1046, 1047, 1045,
       1046, 1047, 1045, 1046, 1047, 1039, 1040, 1041, 1039, 1040, 1041,
       1039, 1040, 1041, 1039, 1040, 1041, 1039, 1040, 1041, 1039, 1040,
       1041], dtype=int64))

first_occurences_mask = np.concatenate([[1], np.diff(arr1)], axis=0) > 0
first_occurences_mask
=> 
array([ True, False, False,  True, False, False,  True, False, False,
        True, False, False,  True, False, False,  True, False, False,
        True, False, False,  True, False, False,  True, False, False,
        True, False, False,  True, False, False,  True, False, False,
        True, False, False,  True, False, False,  True, False, False], dtype=bool)

res1, res2 = (arr1[first_occurences_mask], arr2[first_occurences_mask])
res1, res2
=> 
(array([479, 480, 481, 482, 650, 651, 652, 653, 654, 708, 709, 710, 711,
       712, 713]),
 array([ 859,  859,  859,  859, 1045, 1045, 1045, 1045, 1045, 1039, 1039,
       1039, 1039, 1039, 1039]))

(顺便说一下,这是一个非常好的第一个问题。在您发布之前,您已经阅读了规则和最佳做法,并且显示了。)

编辑(@alejandro) - 时间比较

为了证明这种方法比@B更快。 M.,下面我对两者进行了比较:

from numpy import array,int64
import numpy as np
import time

time1 = []
time2 = []

nelements = np.logspace(1,7)

for i in nelements:
    arr = np.random.randint(0,i, i)

    start = time.time()
    first_occurences_mask = np.concatenate([[1], np.diff(arr)], axis=0) > 0
    stop = time.time()
    time1.append(stop-start)

    start = time.time()
    np.unique(arr,return_index=True)
    stop = time.time()
    time2.append(stop-start)

得出以下结果:

enter image description here

这个图清楚地表明,对于大数组,使用连接的速度是巨大的

答案 1 :(得分:1)

使用np.unique

In [1]: i,j = nozeros  # your two arrays.
In [3]: uniq,index,count=np.unique(i,return_index=True,return_counts=True)

uniq中的唯一元素og:

In [4]: uniq
Out[4]: 
array([479, 480, 481, 482, 650, 651, 652, 653, 654, 708, 709, 710, 711,
       712, 713], dtype=int64)

如果你想要j中的最后一个对应元素,例如你的例子:

In [5]: j[index+count-1]
Out[5]: 
array([ 861,  861,  861,  861, 1047, 1047, 1047, 1047, 1047, 1041, 1041,
       1041, 1041, 1041, 1041], dtype=int64)