使用family = gaussian（标识链接）调用glmer（）中的错误

Question

我正在尝试修复一个带有53个obs的数据帧的glmm。 17个变量。所有变量都是标准化的，但不遵循正态分布并且没有缺失值。数据框的str（）如下所示。

• 种类：因子w / 19级＆＃34; spp1＆＃34;，＆＃34; spp2＆＃34;，...：5 18 12 15 19 4 6 14 16 5 ...
• 协会：因子w / 4级＆＃34; assoA＆＃34;，＆＃34; assoB＆＃34;，..：1 1 2 2 2 3 3 4 4 1 ...
• 网站：因素w / 2级＆＃34; site1＆＃34;，＆＃34; site2＆＃34;：1 1 1 1 1 1 1 1 2 ...
• obs.no：int 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
• trait1：num 0.652 0.428 0.535 0.389 0.486 ...
• trait2：num 0.135 0.16 0.134 0.142 0.159
• （剪辑后的特质3至13）

我执行了以下代码来检查站点之间对给定特征的关联类的重要性。

model1= glmer(trait1 ~ association+site+ (1 | species),data=df6,family=gaussian)

并收到以下错误。

  

在glmer中（trait1~association + site +（1 | species），data = df6，：     使用family = gaussian（identity link）调用glmer（）作为lmer（）的快捷方式已被弃用;请直接致电lmer（）

在此之后我想用Gauss-Hermite求积法估计参数。任何修复此错误的建议和执行Gauss-Hermite正交的代码都非常感谢。

Answer 1

你实际上发布了答案。使用lmer，而不是glmer：

model1 = lmer(trait1~association+site+(1|species), data=df6)