python散点图区域大小比例轴长度

时间:2016-04-06 17:41:34

标签: python axis scatter-plot area scatter

我对此非常绝望,到目前为止,我无法在www上找到任何内容。

以下是这种情况:

  • 我正在使用Python。
  • 我有3个数组:x坐标,y坐标和半径。
  • 我想用给定的x坐标和y坐标创建散点图。

到目前为止,一切都按照我的意愿行事。这就是困扰我的事情:

  • 散点图中每个点的圆周大小应由半径数组定义。
  • 坐标和半径的值以相同的单位表示。更明确地说:假设我在(1,1)处指定半径为0.5的点。然后我想在以(1,1)为中心的图中得到一个圆,并且边界通过点(1.5,1),(1,1.5),(0.5,1)和(1,0.5)

我正在努力的是找出绘图点与轴长度的比率。我需要使用点,因为据我所知,散点图的圆周大小以点值给出。所以如果我们说我的轴从0到10,我需要知道图中有多少点。

任何人都可以帮助我吗?还是有另一种方法吗? 提前谢谢。

1 个答案:

答案 0 :(得分:2)

我从你的另一个stackoverflow question跳了进来。我认为您提出的answer to the present question方法无法正常工作,原因如下:

  • 首先,标记的大小以点为单位,而不是以像素为单位。在排版中,the point是最小的度量单位,在matplotlib中对应于1/72英寸的固定长度。相反,像素的大小将根据图dpi和大小而变化。
  • 其次,plt.scatter中标记的大小与圆的直径有关,而与半径无关。

因此,每个标记的点数大小应计算为:

size_in_points = (2 * radius_in_pixels / fig_dpi * 72 points/inch)**2

此外,如下面的MWE所示,可以直接用matplotlib transformations计算标记半径的大小(以像素为单位),而不必预先生成空图:

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt

plt.close('all')

# Generate some data :
N = 25
x = np.random.rand(N) + 0.5
y = np.random.rand(N) + 0.5
r = np.random.rand(N)/10

# Plot the data :
fig = plt.figure(facecolor='white', figsize=(7, 7))
ax = fig.add_subplot(111, aspect='equal')
ax.grid(True)
scat = ax.scatter(x, y, s=0, alpha=0.5, clip_on=False)
ax.axis([0, 2, 0, 2])

# Draw figure :
fig.canvas.draw()

# Calculate radius in pixels :
rr_pix = (ax.transData.transform(np.vstack([r, r]).T) -
          ax.transData.transform(np.vstack([np.zeros(N), np.zeros(N)]).T))
rpix, _ = rr_pix.T

# Calculate and update size in points:
size_pt = (2*rpix/fig.dpi*72)**2
scat.set_sizes(size_pt)

# Save and show figure:
fig.savefig('scatter_size_axes.png')
plt.show()

enter image description here

指定半径为0.5的(1,1)点将导致图中的圆以(1,1)为中心,边界通过点(1.5,1),(1,1.5), (0.5,1)和(1,0.5):

enter image description here