使用vtkContourFilter从DICOM文件，组织，VTK渲染3D模型，如何设置正确的值？

Question

我正在使用VTK从DICOM文件渲染3D模型。我希望能够通过组织显示模型组织。我的意思是，例如，只显示骨骼，或仅显示皮肤等......

我发现这个有用的类vtkContourFilter。有了它，就可以做类似的事情：

vtkContourFilter *filter = vtkContourFilter::New();
filter->SetValue(0, 650);

第二个值越高，它在模型中越深。这样，通过我的dicom文件样本，我只能显示值为650的骨骼。

如果我将它设置为-150，我可以看到皮肤。

所以，如果我这样做：

filter->SetValue(0, 650);
filter->SetValue(1, -150);

我将有两个轮廓，骨骼和皮肤。

问题是，我手动尝试了不同的值来知道在哪里停下来看骨头等等......从一个样本到另一个样本可能会有所不同。有没有办法让它自动化？可能是在dicom文件中设置了什么内容？

Answer 1

我假设您正在询问CT扫描中的DICOM数据。在这种情况下，体素值以Hounsfield单位给出，遵循与设备无关的scale (Wikipedia)。但是，正如您可以在该页面上阅读的那样，边界并不精确，并且没有关于DICOM数据中边界的其他信息。要确定准确的阈值，您必须对存在大量different algorithms的数据进行细分，包括确定最佳阈值（例如Otsu）。

要了解这一点，您可以使用交互式细分工具尝试一些DICOM查看器，例如： MITK Workbench，3D Slicer或ITK Snap。