Question

我习惯于perl和R的新手。我知道你可以使用read.table()读取整个表格，但我想知道如何使用R来解析输入文件中的一行。

具体来说，相当于以下perl片段：

open my $fh, $filename or die 'can't open file $filename';
my $line = <$fh>;
my ($first, $second, $third) = split ("\t", $line);

Answer 1

与上述类似：

filename <- 'your/file/name/here'
fh <- file( filename, open='rt' )
line <- readLines(fh, n=1 )
tmp <- strsplit(line, "\\t")
first <- tmp[[1]][1]; second <- tmp[[1]][2]; third <- tmp[[1]][3]

文件功能创建与文件的连接并打开它，打开是可选的，但是如果你不打开文件，那么当你从中读取它时它会打开然后再次关闭文件，如果你打开文件然后它保持打开状态，下一次读取继续前一个左边的位置（最接近Perl将在上面做的那样）。

readLines函数将读取指定的行数（在本例中为1）那么strsplit的工作原理与Perl split函数基本相同。

R没有像Perl那样的多重赋值（通常最好只将结果保持在一起而不是分成多个全局变量）。

Answer 2

一般情况下，您应该使用scan执行此操作，或者在更复杂的情况下使用readLines阅读整个文件，并使用strsplit s grep手动解析它s和东西。

在你的情况下：

scan(filename,character(0),nmax=3)->d
first<-d[1];d[2]->second;third<-d[3]

Answer 3

只是为了表明另一种方法（假设你的输入是“temp / 3.txt”）：

> d <- read.csv("temp/3.txt", sep="\t", stringsAsFactors=F, header=F, nrows=1)
# Show the default column names:
> colnames(d)
[1] "V1" "V2" "V3"
# Assign the requested column names
> colnames(d) <- c("first", "second", "third")
# Show the current structure of d
> d
  first second third
1     1      2     3
# Probably not recommended: Add the columns of d to the search path
> attach(d)
> first
[1] 1
# Clean up:
> detach(d)

我想在解决你的问题方面，上面最重要的部分就是

nrows=1

告诉它解析一行输入。（在read.csv下面最终只是调用扫描。）

R中的基本输入文件解析

3 个答案: