Galaxy NGS未显示已安装的工具

时间:2016-04-01 15:01:37

标签: bioinformatics galaxy

我在Ubuntu服务器上运行Galaxy NGS实例,具有基本配置,postgresql数据库和apache。

当我在Galaxy界面中以Admin身份登录,并尝试通过工具棚添加新工具时,该工具已安装,我可以毫无问题地使用它

但是,如果需要重新启动Galaxy,则该工具不再出现

我按照说明here配置了一个文件夹来保存已安装的工具,就像在那里解释的那样,在config.ini中添加了一行所需的文件夹

tool_dependency_dir = dependency_dir

但这并不能解决问题,而且工具也没有存储在文件夹中

有人对我可能遗失的东西有所了解吗?

1 个答案:

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从apache切换到nginx并将我发布的行更改为

后问题得以解决
tool_dependency_dir = /home/galaxy/tool_deps

我找到了一个很好的资源,帮助我完成配置,以防有人遇到同样的问题。

https://wiki.galaxyproject.org/Events/BioITWorld2014/W14#Setting_up_a_Local_Galaxy_Tutorial_.28Part_I.29