从Java Servlet

时间:2016-04-01 11:23:45

标签: java r tomcat servlets renjin

我试图在TomCat 7.0上运行Eclipse中作为IDE运行的一些 R代码来自Java Servlet

END目标是创建一个在 TOMCAT JETTY 上运行的网站,以显示图表+数据使用R函数作为Base 64代码返回的现有R代码,以及一些现有Java和Python函数的结果,例如处理和创建高级Excel文件。

(我不会因为很多原因而使用R Shiny Server,所以我想从Java运行R / Python)

为了获得基本设置,我创建了一个动态Web项目,其中包含一个简单的servlet和一个可以运行R代码的test.java文件。

test.java:

public class test {
      public static void main(String[] args) throws Exception {
          System.out.println(DoR.collectR());
      }
}

DoR.java:

import javax.script.ScriptEngine;
import javax.script.ScriptEngineManager;
import javax.script.ScriptException;

public class DoR {

  public static Object collectR() {
    ScriptEngineManager manager = new ScriptEngineManager();
    ScriptEngine engine = manager.getEngineByName("Renjin");
    if(engine == null) {
        throw new RuntimeException("Renjin Script Engine not found on the classpath.");
    }
    Object catchR = "XX";
    try {
        catchR = engine.eval("df <- data.frame(x=1:10, y=(1:10)+rnorm(n=10));"
                + "print(df);"
                + "print(lm(y ~ x, df))");
    } catch (ScriptException e) {
        e.printStackTrace();
    }
    return catchR;
   }
}

StartTestServlet.java:

import java.io.IOException;
import javax.servlet.ServletException;
import javax.servlet.annotation.WebServlet;
import javax.servlet.http.HttpServlet;
import javax.servlet.http.HttpServletRequest;
import javax.servlet.http.HttpServletResponse;

@WebServlet("/StartTestServlet")
public class StartTestServlet extends HttpServlet {
  private static final long serialVersionUID = 1L;

  public StartTestServlet() {
    super();
  }

  protected void doGet(HttpServletRequest request, HttpServletResponse response) throws ServletException, IOException {
    //response.getWriter().append("Served at: ").append(request.getContextPath()).append((CharSequence) DoR.collectR());
    response.getWriter().append("Served at: ").append(request.getContextPath());
  }

  protected void doPost(HttpServletRequest request, HttpServletResponse response) throws ServletException, IOException {
    doGet(request, response);
  }
}

我安装了库:

renjin-script-engine-0.7.0-RC2.jar
renjin-studio-0.8.1915-jar-with-dependencies.jar
slf4j-api-1.7.19.jar
slf4j-simple-1.7.19.jar
  

如果我将test.java作为Java应用程序运行,它可以正常工作。

     

如果我在TomCat 7.0服务器上运行servlet它工作正常(没有.append((CharSequence)DoR.collectR()))

     

如果我用.append((CharSequence)DoR.collectR())运行代码,我得到异常:

java.lang.RuntimeException: Renjin Script Engine not found on the classpath.
    ......DoR.collectR(DoR.java:16)
    ......StartTestServlet.doGet(StartTestServlet.java:19)
    javax.servlet.http.HttpServlet.service(HttpServlet.java:621)
    javax.servlet.http.HttpServlet.service(HttpServlet.java:728)
    org.apache.tomcat.websocket.server.WsFilter.doFilter(WsFilter.java:51)

DoR.java:16是以下行:

try {

StartTestServlet.doGet(StartTestServlet.java:19)是以下行:

response.getWriter().append("Served at: ").append(request.getContextPath()).append((CharSequence) DoR.collectR());
  

我一直在尝试各种各样的东西,以便在Eclipse版本中运行:Mars.1发布(4.5.1)并从Renjin下载示例文件/搜索互联网等等但现在没有运气,现在为了获得从Servlet内部运行的R代码。

     

我忽略了一些简单的事情,还是我需要完全不同?

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

查看eclipse-dynamic-web-project中的(新添加的)Renjin Examples。总结自述文件:

  1. Renjin Downloads Page下载独立的renjin-script-engine-0.8.1931-jar-with-dependencies.jar。您似乎将旧版的renjin-script-engine与GUI jar结合在一起。
  2. 将此JAR复制到WebContent / WEB-INF / lib,以便与您的应用程序一起部署。
  3. 另请查看您的&#34; DoR&#34;方法:您正在调用print(),它将其输出发送到标准输出并返回NULL。在网络服务器上,这可能会被发送到日志,但肯定不会在对客户端的响应中结束。

    如果要将lm()函数的结果发送给客户端, 例如,您可以使用rjson :: toJSON()序列化它。