Python中的差异基因表达分析

Question

似乎RNA-Seq的大多数差异基因表达包都写在R中。

Examples include:

- edgeR
- limma
- DESeq

是否有任何类似（且易于使用）的软件包可用于Python，或者是否已移植任何R软件包？

我能找到的最好的是：

• https://bcbio.wordpress.com/2009/09/13/differential-expression-analysis-with-bioconductor-and-python/
• http://dept.stat.lsa.umich.edu/~kshedden/Python-Workshop/gene_expression_comparison.html

但我真的不想使用rpy2（ 1st link ）。第二个环节可能就是我要开始的地方，但我首先要确保我不会重新发明轮子。