移动ff文件后加载ff对象

时间:2016-03-29 22:01:19

标签: r ff

我使用CNSet包创建了crlmm包创建的ff对象。

我将其保存为RData文件(使用save功能,而不是ffsave)。然后我不得不将我的ff文件移到另一个位置。然后我尝试使用load函数加载对象。但是当我访问对象的一部分时,我收到的错误是原始位置中的ff文件无法找到。

我使用ldPath功能设置新位置,但它仍然在寻找旧路径。

示例:

library(ff)
ldPath('/new_location')
load('object.RData')
summary(g)
#Works, print:
#Length  Class   Mode
#1  CNSet     S4

calls(g)[1]
#Raises the next error:
  

打开ff /old/location/calld49920a2df79.ff

     

错误:file.access(filename,0)== 0不为TRUE

physical(x)
  

NULL

任何帮助将不胜感激。

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

您可以使用ff指定x对象physical(x) <- 'my_file.ff'的文件路径。例如:

library(ff)

old <- file.path(tempdir(), 'old.ff')         # this will be the original file path
new <- file.path(tempdir(), 'new.ff')         # this will be the new file path
x <- ff(1:4, filename=old)                    # create the original ff file
save(x, file = file.path(tempdir(), 'x.rda')) # save the ff object
close(x)                                      # close the ff object
file.rename(old, new)                         # rename the file
file.remove(old)                              # delete the old file
load(file.path(tempdir(), 'x.rda'))           # load the ff object
physical(x)$filename <- new                   # assign the new file path 

head(x)
## opening ff C:\Users\John\AppData\Local\Temp\Rtmp2ZEkgw/new.ff
## [1] 1 2 3 4