我的数据框看起来像这个玩具示例:
Ind ID RegionStart RegionEnd Value TN
1 A 1 100 3 N
1 A 101 200 2 N
2 A 1 100 3 T
2 A 101 200 2 T
3 B 1 100 3 N
3 B 101 200 2 N
4 B 1 100 5 T
4 B 101 200 5 T
我有4个人,实际上是2对(参考,N和主题,T)。为简单起见,只有2对,只有2个区域。在我的真实文件中,有> 500对和> 60,000个区域。这些区域都有相同的开始和结束,因此没有重叠。
我想做的是根据ID
+ region
匹配个人,如果
Value
是!= 3(不等于3)& Value
该区域中的T-个体匹配(例如,N-ind = 2& T-ind = 2),然后在N&中更改相应的Value
T个人到3。
上面的结果表是:
Ind ID RegionStart RegionEnd Value TN
1 A 1 100 3 N
1 A 101 200 3 N
2 A 1 100 3 T
2 A 101 200 3 T
3 B 1 100 3 N
3 B 101 200 2 N
4 B 1 100 5 T
4 B 101 200 5 T
请注意,ID=B
,地区1-100
未更改Value
,因为N' Value = 3
;区域101-200
,因为N& Value
而没有变化T不一样。
我想过使用dplyr对匹配进行分组,例如:
df <- df %>% arrange(ID, Ind, RegionStart, TN) %>% group_by(ID)
或者也许使用data.table,但设置ID作为键?但我还是不确定如何轻松比较行。我对dplyr&amp; data.table,所以如果使用这些命令,那么命令的简短说明会很棒。不过,请随意使用其他包装。但数据非常大,因此需要高效。
答案 0 :(得分:4)
使用data.table:
library(data.table)
setDT(DF)
DF[, Value := {
fixit = ( Value[TN=="N"] != 3L ) & ( uniqueN(Value) == 1L )
if (fixit) 3L else Value
}, by=.(ID, RegionStart)]
请注意,这将更改原始数据集(而不是简单地返回更改的表格)。
使用dplyr:
library(dplyr)
DF %>% group_by(ID, RegionStart) %>%
mutate(Value = {
fixit = ( Value[TN=="N"] != 3L ) & ( n_distinct(Value) == 1L )
if (fixit) 3L else Value
})
工作原理: uniqueN
和n_distinct
计算向量中不同值的数量。如果Value
的两个元素相同,则返回1L
。