Question

我正在使用plotly转换ggplot2图表并将它们放入knitr html输出中。这是报告的工作副本。 http://rpubs.com/kausti/NSEFO-23-Mar-2016 第一张图是情节图，而下面的图则不是。我希望他们是情节图表，但我被卡住了。

在下面的代码中，plotChart函数返回一个ggplot2图。这段代码有效！

for (tick in tradeOps$ticker)
{
  tmpDF = filter(tradeOps, ticker == tick)
  p = plotChart(tick = tick,Entry = tmpDF$Entry, Target =     tmpDF$Target, SL= tmpDF$SL, TradeType = tmpDF$TradeType, data = wd)
  p = p + annotate("text", x = as.Date(tmpDF$Date)+30, y =   tmpDF$Entry, label = tmpDF$Entry, colour = "blue")
  p = p + annotate("text", x = as.Date(tmpDF$Date)+30, y = tmpDF$Target, label = tmpDF$Target)
  p = p + annotate("text", x = as.Date(tmpDF$Date)+30, y = tmpDF$SL, label = tmpDF$SL)

  print(p)

}

现在如果我将最后一个打印语句更改为print(ggplotly(p))，它就不会在html中打印图表。该代码完美地在knitr之外工作。

此外，print(ggplotly(p))在循环外完美运行。我错过了什么吗？

修改

包括下面的可复制示例。以下是我的rmd文件。

---
title: "tmp"
output: html_document
---

```{r, echo=FALSE, message=FALSE, fig.width=8, fig.height=6}
library(ggplot2)
library(plotly)
library(dplyr)
s = NULL
a = data.frame(id = 1:15,x = 2:16, y = 15:1, z = c(rep("a",5),rep("b",5),rep("c",5)))
for(i in unique(a$z)){
  s = a[a$z == i,]
  print(ggplot(s,aes(x = x, y = y)) + geom_point())
}

```

这与显示三个图形的输出html完美配合。现在，只需将最后一个print语句更改为 print(ggplotly(ggplot(s,aes(x = x, y = y)) + geom_point()))生成一个没有任何错误的空白HTML。

在终端中运行相同的代码完美无缺

library(ggplot2)
library(plotly)
library(dplyr)
s = NULL
a = data.frame(id = 1:15,x = 2:16, y = 15:1, z = c(rep("a",5),rep("b",5),rep("c",5)))
for(i in unique(a$z)){
  s = a[a$z == i,]
  print(ggplotly(ggplot(s,aes(x = x, y = y)) + geom_point()))
}

感谢任何帮助。

谢谢， Kaustubh

Answer 1

事实证明问题在这里得到了解决 https://github.com/ropensci/plotly/issues/273

knitr已经知道在循环中打印图表图表的问题。从这里引用最终答案cpsievert

```{r}
l <- htmltools::tagList()
for (i in 1:3) {
  l[[i]] <- as.widget(plot_ly(x = rnorm(10)))
}
l
```

这解决了我的问题。虽然在我找到这个解决方案之前，我最终将所有内容从ggplot2移植到plotly R api。

MLavoie，谢谢你的帮助。我创建了一个虚拟数据集，只是为了创建一个可重现的例子。虽然您的解决方案可能解决了虚拟示例，但在当前问题中并非与我相关。我认为这里提供的解决方案应该是通用的。

谢谢， Kaustubh

Answer 2

我有几个替代方案。如果它有用，请告诉我！

Suggestion1（使用plotly的基础subplot）：

```{r, echo=FALSE, message=FALSE, fig.width=8, fig.height=6}
library(ggplot2)
library(plotly)
library(dplyr)
s = NULL
a = data.frame(id = 1:15,x = 2:16, y = 15:1, z = c(rep("a",5),rep("b",5),rep("c",5)))
a$id2 <- as.integer(a$z)
p <- plot_ly(a, x = x, y = y, group=z, xaxis = paste0("x", id2), mode = "markers")
p <- subplot(p, nrows=3)
p

```

Suggestion2（使用ggplot2但使用facet）：

```{r, echo=FALSE, message=FALSE, fig.width=8, fig.height=6}
library(ggplot2)
library(plotly)
library(dplyr)
s = NULL
a = data.frame(id = 1:15,x = 2:16, y = 15:1, z = c(rep("a",5),rep("b",5),rep("c",5)))
ggplotly(ggplot(a,aes(x = x, y = y)) + geom_point() + facet_grid(z~.))

```

在for循环中绘制Plotly图表

2 个答案: