在Windows 10

时间:2016-03-26 02:43:02

标签: python r pip rpy2 jupyter-notebook

我想在我的labtop上使用 rpy2 库。但是我整个上午都安装不了。

这里发布了一些问题。任何建议将不胜感激!

尝试1

使用pip install rpy2。结果显示如下:

 Complete output from command python setup.py egg_info:
    Error: Tried to guess R's HOME but no command (R) in the PATH.

    ----------------------------------------
Command "python setup.py egg_info" failed with error code 1 in c:\users\hyf\appdata\local\temp\pip-build-gkdpb0\rpy2\  

尝试2

然后,我读了一些帖子。有人告诉说用 .whl 格式包可以解决问题。所以: 使用pip install rpy2-2.7.8-cp27-none-win_amd64.whl安装我下载的软件包。失败:

IOError: [Errno 13] Permission denied: 'D:\\Program\\Anaconda\\Lib\\site-packages\\rpy2\\rinterface\\_rinterface.pyd'

尝试3

使用conda install --channel https://conda.binstar.org/joshadel rpy2,可以安装rpy2软件包。

但是当我在ipython笔记本中这样称呼它时:

import rpy2
from rpy2.robjects import r

结果显示错误:

RuntimeError: R_HOME not defined.

但我已将环境变量添加到系统变量中,如下所示:

R_HOME:D:\Program\R\bin\x64
R_User:D:\Program\Anaconda\Lib\site-packages\rpy2   

我使用Anaconda和Python2.7内核以及R 3.2.2。

1 个答案:

答案 0 :(得分:3)

显然,R_HOME应该引用根R目录,从__init__文件中出现这些行

# Load the R dll using the explicit path
R_DLL_DIRS = ('bin', 'lib')
# Try dirs from R_DLL_DIRS
for r_dir in R_DLL_DIRS:
    Rlib = os.path.join(R_HOME, r_dir, _win_bindir, 'R.dll')

其中_win_bindir将引用x64或32位版本。因此,从shell(或更永久地更改系统设置),您可以将环境变量设置为

set R_HOME=D:\Program\R

并尝试python(从那个shell!)。