精确控制学术论文的Seaborn图中的字体大小

时间:2016-03-25 13:26:07

标签: python matplotlib plot seaborn

我目前正在尝试使用Seaborn为我的学术论文创建情节。这些图看起来很棒且易于生成,但是我遇到的一个问题是对图中的字体大小进行了精细控制。

我的论文中的字体大小为9pt,我想确保我的图中的字体大小为9pt或10pt。但在seaborn中,字体大小主要通过字体比例sns.set_context("paper", font_scale=0.9)来控制。因此,除非通过反复试验,否则我很难找到合适的字体大小。有没有更有效的方法来做到这一点?

我还想确保不同的seaborn图之间的字体大小一致。但并非所有我的seaborn图都具有相同的尺寸,所以看起来在所有图上使用相同的font_scale 并不一定会在这些不同的图上创建相同的字体大小?

我已在下面附上我的代码。我很感激有关如何为两栏学术论文格式化图表的任何评论。我的目标是能够控制图形的大小而不会扭曲字体大小或图形。我用Latex写论文。

# Seaborn setting                                                                                                                                              
sns.set(style='whitegrid', rc={"grid.linewidth": 0.1})
sns.set_context("paper", font_scale=0.9)                                                  
plt.figure(figsize=(3.1, 3)) # Two column paper. Each column is about 3.15 inch wide.                                                                                                                                                                                                                                 
color = sns.color_palette("Set2", 6)

# Create a box plot for my data                                                      
splot = sns.boxplot(data=df, palette=color, whis=np.inf,                              
        width=0.5, linewidth = 0.7)

# Labels and clean up on the plot                                                                                                                                                                                                                                                                                              
splot.set_ylabel('Normalized WS')                                                     
plt.xticks(rotation=90)                                                               
plt.tight_layout()                                                                    
splot.yaxis.grid(True, clip_on=False)                                                 
sns.despine(left=True, bottom=True)                                                   
plt.savefig('test.pdf', bbox_inches='tight')                                          

2 个答案:

答案 0 :(得分:24)

你是对的。这是一个记录严重的问题。但是,您可以在构建绘图后直接更改字体大小参数(与字体比例相反)。请检查以下示例:

import seaborn as sns
tips = sns.load_dataset("tips")

b = sns.boxplot(x=tips["total_bill"])
b.axes.set_title("Title",fontsize=50)
b.set_xlabel("X Label",fontsize=30)
b.set_ylabel("Y Label",fontsize=20)
b.tick_params(labelsize=5)
sns.plt.show()

,结果如下:

Different font sizes for different labels

为了使图表之间保持一致,我认为您只需要确保DPI是相同的。顺便说一下它'也可以自定义rc dictionaries,因为" font.size"参数存在,但我不太清楚如何做到这一点。

注意:我也不太明白为什么他们更改了轴标签和刻度的字体大小变量的名称。似乎有点不直观。

答案 1 :(得分:13)

这完全令人满意,不是吗?我在设置上下文时指定的最简单方法,例如:

sns.set_context("paper", rc={"font.size":8,"axes.titlesize":8,"axes.labelsize":5})   

这应该照顾90%的标准绘图用法。如果您希望ticklabels小于axis标签,请设置' axes.labelsize'更小的(ticklabel)值并手动指定轴标签(或其他自定义元素),例如:

axs.set_ylabel('mylabel',size=6)

您可以将其定义为函数并将其加载到脚本中,这样您就不必记住标准数字,或者每次都调用它。

def set_pubfig:
    sns.set_context("paper", rc={"font.size":8,"axes.titlesize":8,"axes.labelsize":5})   

当然你可以使用configuration files,但我想整个想法是有一个简单,直接的方法,这就是上述方法运作良好的原因。

注意:如果您指定了这些数字,则即使您设置了所有指定的字体元素,也会忽略在font_scale中指定sns.set_context