Question

我们将所有实验室数据保存在Sybase数据库中。当我想进行数据处理和分析时，我用RODBC将数据读入R中。

library(RODBC)
channellab <- odbcConnect("Labdata")
indivs <-sqlQuery(channellab,'SELECT * from CGS.Specimen')

到目前为止一直很好，除了CGS.Specimen是我们整个实验室馆藏的表格。有近40000个标本（行）有66个变量。这需要花费不必要的时间来阅读，特别是当我只对一项有大约1000个标本的研究感兴趣时。解决这个问题的明显方法是

indivs <-sqlQuery(channellab,'SELECT * from CGS.Specimen WHERE StudyCode="RP"')

但是当我跑步时，我得到了

[1]“42S22 -143 [Sybase] [ODBC驱动程序] [Adaptive Server Anywhere]未找到列：未找到列'RP'”“[RODBC]错误：无法从CGS.Specimen中获取SQLExecDirect'SELECT * WHERE StudyCode = \“RP \”'“

我玩了引号，我玩过逃生斜线，但唉，我已经无处可去了。

例如

indivs <-sqlQuery(channellab,'SELECT * from CGS.Specimen WHERE StudyCode= 'RP'  ')

错误：“indivs＆lt; -sqlQuery（channellab，'SELECT * from CGS.Specimen WHERE StudyCode ='RP”

中的意外符号

indivs <-sqlQuery(channellab,"SELECT * from CGS.Specimen WHERE StudyCode= 'RP'  ")

.Call（C_RODBCFetchRows，attr（channel，“handle_ptr”），max，buffsize，出错：不允许使用负长度载体

你有什么建议？

Answer 1

您报告的最后一个错误是从.Call函数到c函数RODBCFetchRows。因此，您的引号问题似乎已得到解决。但是，由于上述错误，您仍然有问题。可能行未正确报告（c函数尝试根据此值分配向量，但不检查负值）。尝试：

indivs <-sqlQuery(channellab,"SELECT * from CGS.Specimen WHERE StudyCode= 'RP'", believeNRows = FALSE)

Answer 2

编辑：

indivs <-sqlQuery(channellab,'SELECT * from CGS.Specimen WHERE StudyCode=\'RP\'')

好的，您可以运行另一个查询，其中返回一些数据？

例如

WHERE StudyCode=StudyCode？这是否会给出与-ve长度相同的错误？

这意味着上述内容对于转义StudyCode是正确的。 -Le长度是另一个错误。你能不能返回所有带有*但没有空值的特定列的列吗？

Answer 3

尝试选项believeNRows = FALSE。这对我来说是一个类似的错误（负长度错误）。

这个问题更重要： Querying Oracle DB from Revolution R using RODBC

为什么WHERE语句在RODBC中的sqlQuery中不起作用？

3 个答案: