条形宽度作为日期范围的条形图在x轴上

Question

我希望制作一个条形图，其中响应变量（重量变化）是在不同长度的时间段内测量的，由开始和结束日期定义。条形的宽度应对应于周期的长度。我的数据的一个小例子：

wtchange.data <- structure(list(start.date = structure(1:3, .Label = c("2015-04-01", 
    "2015-04-15", "2015-04-30"), class = "factor"), end.date = structure(1:3, .Label = c("2015-04-15", 
    "2015-04-30", "2015-05-30"), class = "factor"), wtchange = c(5L, 
    10L, 15L), se = c(1.2, 2.5, 0.8)), .Names = c("start.date", "end.date", 
    "wtchange", "se"), class = "data.frame", row.names = c(NA, -3L
    ))

wtchange.data
#   start.date   end.date wtchange  se
# 1 2015-04-01 2015-04-15        5 1.2
# 2 2015-04-15 2015-04-30       10 2.5
# 3 2015-04-30 2015-05-30       15 0.8

wtchange.data$start.date <- as.Date(wtchange.data$start.date)
wtchange.data$end.date <- as.Date(wtchange.data$end.date)

尝试使用geom_bar：

library(ggplot2)
ggplot(wtchange.data, aes(x = start.date, y = wtchange)) +
  geom_bar(stat = "identity", color = "black") +
  geom_errorbar(aes(ymin = wtchange-se, ymax = wtchange+se), width = 1)

（不允许＆gt; 2个链接＆lt; 10声望，所以遗憾的是不能显示第一个情节）

主要问题是，当定义绘图区域的美学（x = start.date, y = wtchange）时，我只能使用一个变量（在本例中为 start.date ）作为x轴，但我真的需要以某种方式使用 start.date 和 end.date 来分隔对应于每个句点的条形宽度。该图应该看起来像这样（在Paint中绘制）：

第二个问题是杆应该没有间隙地接触，但是我不确定它是否可能，因为杆必须具有不同的宽度，所以你不能为所有杆设置一个杆宽。是否可以手动设置每个条的宽度？

编辑： 感谢Henrik的链接。我取得了一些进一步的进展。 我计算了日期中点以使条形图居中：

wtchange.data$date.midpoint <- wtchange.data$start.date +
(wtchange.data$end.date - wtchange.data$start.date)/2

然后计算使用条宽度的周期长度：

wtchange.data$period.length <- wtchange.data$end.date - wtchange.data$start.date

现在更新的图代码：

ggplot(wtchange.data, aes(x = date.midpoint, y = wtchange)) +
  geom_bar(stat = "identity", color = "black", width = wtchange.data$period.length) +
  geom_errorbar(aes(ymin = wtchange-se, ymax = wtchange+se), width = 1)

剩下的唯一问题是在一个地方的酒吧之间仍然存在小的差距。我想这是由于R将日期差异计算方法计算到最接近的天数？

Answer 1

你是对的：它是结束日期和开始日期之间差异的计算，这是差距的原因。在计算宽度和中点时，我们需要使用numeric句点而不是difftime（请参阅下面的说明）。

# length of periods, width of bars as numeric
df$width <- as.numeric(df$end.date - df$start.date) 

# mid-points
df$mid <- df$start.date + df$width / 2

# dates for breaks 
dates <- unique(c(df$start.date, df$end.date))

ggplot(df, aes(x = mid, y = wtchange)) +
  geom_bar(stat = "identity", color = "black", width = df$width) +
  geom_errorbar(aes(ymin = wtchange - se, ymax = wtchange + se), width = 1) +
  scale_x_date(breaks = dates)

相应的geom_rect代码：

# mid-points
df$mid <- df$start.date + as.numeric(df$end.date - df$start.date) / 2

# dates for breaks 
dates <- unique(c(df$start.date, df$end.date))

ggplot(df, aes(x = mid, y = wtchange)) +
  geom_rect(aes(xmin = start.date, xmax = end.date, ymin = 0, ymax = wtchange), color = "black") +
  geom_errorbar(aes(ymin = wtchange - se, ymax = wtchange + se), width = 1) +
  scale_x_date(breaks = dates)

geom_step对墨水的要求略低：

# need to add an end date to the last period
df2 <- tail(df, 1)
df2$start.date <- df2$end.date
df2 <- rbind(df, df2)

# mid-points
df$mid <- df$start.date + as.numeric(df$end.date - df$start.date) / 2

ggplot() +
  geom_step(data = df2, aes(x = start.date, y = wtchange)) +
  geom_errorbar(data = df, aes(x = mid, ymin = wtchange - se, ymax = wtchange + se), width = 1) +
  scale_x_date(breaks = dates) +
  ylim(0, 16) +
  theme_bw()

关于“difftime问题”：

班级Date的值可以在内部表示为小数天（请参阅?Date和?Ops.Date;尝试：Sys.Date(); Sys.Date() + 0.5; {{1} }）。但是，在向Sys.Date() + 0.5 + 0.5添加difftime对象时，Date对象舍入最近的一整天（请参阅difftime中的x参数1}}）。

让我们使用您的开始日期?Ops.Date和结束日期2015-04-15检查计算结果：

2015-04-30

因此，我们使用的是mid <- (as.Date("2015-04-30") - as.Date("2015-04-15")) / 2 mid # Time difference of 7.5 days str(mid) # Class 'difftime' atomic [1:1] 7.5 # ..- attr(*, "units")= chr "days" # calculate the midpoint using the difftime object as.Date("2015-04-15") + mid # [1] "2015-04-23" # calculating midpoint using numeric object yields another date... as.Date("2015-04-15") + as.numeric(mid) # [1] "2015-04-22" # But is "2015-04-15" above in fact fractional, i.e. "2015-04-22 point 5"? # Let's try and add 0.5 as.Date("2015-04-15") + as.numeric(mid) + 0.5 # [1] "2015-04-23" # Yes. 期，而不是numeric期。