我想在R中使用编程方法创建多个比较。这在完整的因子设计中就像我使用gen.factorial()函数AlgDesign包时一样。有人能告诉我如何从我的代码中创建它,因为我不能直接使用gen.factorial()函数,因为在我的实际数据中我有不平衡的数据。
treat <- gl(4, 15, labels = paste("t", 1:4, sep="")); treat
set.sed(125)
sp <- cbind(c(rnorm(10, 5, 0.25), rnorm(50, 2.5, 0.25)), rnorm(60, 2.5, 0.25),
c(rnorm(10, 12, 0.25), rnorm(50, 2.5, 0.25)), rnorm(60, 2.5, 0.25))
colnames(sp) <- c("sp1", "sp2", "sp3", "sp4")
TI <- model.matrix(~ treat-1)
head(TI)
f <- nlevels(treat)
comb <- t(combn(1:f, 2))
n <- nrow(comb)
contr2 <- NULL
for (x in 1:n) {
i <- comb[x, 1]
j <- comb[x, 2]
tmp <- list(TI[,i] - TI[,j]); names(tmp) <- paste0("TI",i, "_", j)
contr2 <- c(contr2, tmp) }
contr2df <- as.data.frame(contr2)
contr2df# OK but incomplete
require(AlgDesign)
contr2df2 <-AlgDesign::gen.factorial(3, 6, TRUE, varNames=c("TI1_2", "TI1_3", "TI1_4", "TI2_3", "TI2_4", "TI3_4"))
contr2df2
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谢谢, 亚历山大