Question

我想在文件夹中添加多个文件以缩短名称。这是输入文件

输入

S_12_O_319_K27ac_S12818.sorted.bam
S_12_O_319_K27me3_S12815.sorted.bam
S_12_O_319_K4me1_S12816.sorted.bam
S_12_O_319_K4me3_S12817.sorted.bam
S_14_AS_11_K27ac_S12843.sorted.bam
S_14_AS_11_K27me3_S12840.sorted.bam
S_14_AS_11_K4me1_S12841.sorted.bam
S_14_AS_11_K4me3_S12842.sorted.bam
S_12_O_319_K27ac_S12818.sorted.bam.bai
S_12_O_319_K27me3_S12815.sorted.bam.bai
S_12_O_319_K4me1_S12816.sorted.bam.bai
S_12_O_319_K4me3_S12817.sorted.bam.bai
S_14_AS_11_K27ac_S12843.sorted.bam.bai
S_14_AS_11_K27me3_S12840.sorted.bam.bai
S_14_AS_11_K4me1_S12841.sorted.bam.bai
S_14_AS_11_K4me3_S12842.sorted.bam.bai

输出

S_12_O_319_K27ac.bam
S_12_O_319_K27me3.bam
S_12_O_319_K4me1.bam
S_12_O_319_K4me3.bam
S_14_AS_11_K27ac.bam
S_14_AS_11_K27me3.bam
S_14_AS_11_K4me1.bam
S_14_AS_11_K4me3.bam
S_12_O_319_K27ac.bam.bai
S_12_O_319_K27me3.bam.bai
S_12_O_319_K4me1.bam.bai
S_12_O_319_K4me3.bam.bai
S_14_AS_11_K27ac.bam.bai
S_14_AS_11_K27me3.bam.bai
S_14_AS_11_K4me1.bam.bai
S_14_AS_11_K4me3.bam.bai

请注意，我的文件有两个不同的扩展名，一个是* .bam，另一个是* .bam.bai。我想立刻重命名所有这些以缩短名称。从所有部分中删除_S12843.sorted部分。请注意，这是第5个下划线，而_S12843后面的数字对于不同的文件是不同的。字符串sorted只有类似的模式。所以想截断整个部分来缩短名称。如何通过bash或重命名或sed实现这一目标。任何帮助，将不胜感激。我能够删除带有排序但不是数字的字符串。

Answer 1

使用rename实用程序，您可以执行以下操作：

rename 's/_[^_.]+\.sorted//' *.sorted.*

如果您没有rename，请使用此for循环：

for f in *.sorted.*; do
   mv "$f" "${f/_S[[:digit:]]*.sorted}"
done

Answer 2

这可能适合你（GNU sed）：

sed -r 's/^(.*)_[^_.]*\.[^.]*(.*)/mv "&" "\1\2"/e' file

或：

sed -r 's/^(.*)_[^_.]*\.[^.]*(.*)/mv "&" "\1\2"/' file | shell

其中shell可以是bash等

在unix中重命名文件夹中的多个文件

2 个答案: