R中的两个数据帧相关

时间:2016-03-12 07:27:19

标签: r correlation

我需要关联一些数据。

我有两个数据框 - df用于患者健康状况,有253列,tax2.melt用于患者的微生物群分析,有3列。

taxt.melt是:

| bac_name             | pat_id | percent      |
|----------------------|--------|--------------|
| Unclassified         | 1      | 5.4506702563 |
| Serratia_entomophila | 1      | 0            |
| Faecalibacterium     | 1      | 4.0394862303 |    
| Clostridium          | 1      | 5.215098996  |

df是一个患者ID_CODE和253个变量

的数据框
| ID_CODE | DIAB_GR | SEX | AGE |  ....  |
|---------|---------|-----|-----|--------|
| 1       | 232     | 0   | 0   |  ....  |
| 2       | 99      | 0   | 0   |  ....  |

因此,我需要将个体患者的病情(如腹部肥胖糖尿病)与肠道微生物群中单个肠道细菌的百分比相关联(如 Faecalibacterium < / em>或 Clostridium

结果应该是包含bac_name df_testvalue corr列的数据框。

谢谢!

你能否告诉我如何在R中做到最好?

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