更改fasta标头以包含计数信息

Question

我有一个包含多行的文件：

  

fg-000001 ATGGATGACCGATGCTAGC 34 23 33 45 34 23 34 35 34 35 56 47

我想将它转换为一个fasta文件，其中包含计数信息的总和以及名称基本上是一个fasta文件

  

FG-000001_x433   ATGGATGACCGATGCTAGC

这可能吗？ 提前谢谢！

Answer 1

此awk脚本应该按照您的要求执行：

awk '{sum=0; for (i=3; i<=NF; i++) {sum += $i}; print $1"_x"sum, $2}' file