以下命令和问题仅仅是为了找出正确的语法,所以请不要寻求它背后的任何深层目的,而是如果你知道正确的语法,这将对我有很大的帮助。
我有以下内容: *在这里使用perl -e来模仿调用system()命令以执行unix命令的perl文件。
perl -e '$i="file.bed"; system("j=$i; echo ${i} ;echo \${j}; echo \${j%.*};")';
这个命令很好地输出:
file.bed
file.bed
file
我想添加另一个echo,将后缀“.bed”替换为后缀“.bam” 我试过了:
perl -e '$i="file.bed"; system("j=$i; echo ${i} ;echo \${j}; echo \${j%.*}; echo \${j/.bed/.bam}")';
但我明白了:
file.bed
file.bed
file
sh: 1: Bad substitution
同样适用于:
perl -e '$i="file.bed"; system("j=$i; echo ${i} ;echo \${j}; echo \${j%.*}; echo \${j\/.bed\/.bam}")';
因此,由于某种原因,后缀删除[%。*]在system()中运行正常,但{//}替换失败。
有什么想法吗?
答案 0 :(得分:5)
perl -e '$i="file.bed"; system("...")'
是
的缩写perl -e '$i="file.bed"; system("/bin/sh", "-c", "...")'
但${j/.bed/.bam}
不支持sh
。使用
perl -e '$i="file.bed"; system("bash", "-c", "...")'