tl; dr 我可以在不使用numpy.reshape的情况下将5x5x5x3x3x3的numpy数组视图重塑为125x1x1x3x3x3吗?
我想对卷(MxMxM的大小)执行滑动窗口操作(具有不同的步幅)。可以使用numpy.lib.stride_tricks.as_strided
生成滑动窗口数组,如Benjamin和Eickenberg之前所建议的那样,并在下面的代码段中演示,该代码段使用helper method from skimage使用as_strided
。
这个辅助方法的输出给我一个NxNxNxnxnxn的形状,但我更喜欢这个形状是N ^ 3x1xnxnxn。虽然我可以使用np.reshape来实现这一点,但是如果音量变大(> 100x100x100),np.reshape会很慢,我不知道为什么。我以为我可以使用as_stride来重塑输出,但是numpy崩溃(下面的代码片段)。关于如何在不使用np.reshape的情况下将助手方法的输出视为N ** 3x1xnxnxn的任何想法?
import numpy as np
import skimage
l = 15
s = 3
X = np.ones((l,l,l))
print('actual shape',X.shape)
view = skimage.util.shape.view_as_blocks(X,(s,s,s))
print('original view',view.shape)
new_shape = ((l/s)**3,1,1,s,s,s)
print('new view',new_shape)
view_correct = view.reshape(new_shape)
print(view_correct.shape)
print('coord:','124,0,0,2,2,2','value:',view_correct[124,0,0,2,2,2])
view_incorrect = np.lib.stride_tricks.as_strided(view, shape=new_shape)
print(view_incorrect.shape)
print('coord:','124,0,0,2,2,2','value:',view_incorrect[124,0,0,2,2,2])
答案 0 :(得分:1)
我从view_as_blocks
中抽取了一个例子,尝试了重塑的风格:
A = np.arange(4*4).reshape(4,4)
B = view_as_blocks(A, block_shape=(2, 2))
print(A.__array_interface__)
print(B.__array_interface__)
C = B.reshape((2*2,2,2))
print(C.__array_interface__)
制造
{'typestr': '<i4', 'data': (153226600, False), 'shape': (4, 4),
'descr': [('', '<i4')], 'version': 3, 'strides': None}
{'typestr': '<i4', 'data': (153226600, False), 'shape': (2, 2, 2, 2),
'descr': [('', '<i4')], 'version': 3, 'strides': (32, 8, 16, 4)}
{'typestr': '<i4', 'data': (150895960, False), 'shape': (4, 2, 2),
'descr': [('', '<i4')], 'version': 3, 'strides': None}
data
和A
的{{1}}指针是相同的; B
是B
的视图。
但是A
的指针是不同的。这是一份副本。这就解释了为什么你需要这么长时间。
让我们这样做有点不同:
C
制造
A = np.arange(4*4).reshape(4,4)
B = view_as_blocks(A, block_shape=(2, 2))
print(A.__array_interface__)
print(B.__array_interface__)
C = B.reshape((2*2,1,2,2))
print(C.__array_interface__)
D = as_strided(B, shape=(2*2,1,2,2))
print(D.__array_interface__)
print(B[1,1,:,:])
print(C[3,0,:,:])
print(D[3,0,:,:])
再次重塑会创建一个副本。第二个1254:~/mypy$ python3 skshape.py
{'strides': None, 'typestr': '<i4', 'version': 3,
'data': (154278744, False), 'shape': (4, 4), 'descr': [('', '<i4')]}
{'strides': (32, 8, 16, 4), 'typestr': '<i4', 'version': 3,
'data': (154278744, False), 'shape': (2, 2, 2, 2), 'descr': [('', '<i4')]}
{'strides': None, 'typestr': '<i4', 'version': 3,
'data': (155705400, False), 'shape': (4, 1, 2, 2), 'descr': [('', '<i4')]}
{'strides': (32, 8, 16, 4), 'typestr': '<i4', 'version': 3,
'data': (154278744, False), 'shape': (4, 1, 2, 2), 'descr': [('', '<i4')]}
[[10 11]
[14 15]]
[[10 11]
[14 15]]
[[ 154561960 -1217783696]
[ 48 3905]]
返回一个视图,但是大步走了。它正在寻找原始数据缓冲区之外的内存(这就是为什么自己玩大步是危险的一部分。)
在我的示例中,查看每个块的第一个角落值
as_strides
对于print(B[:,:,0,0])
print(C[:,0,0,0])
[[ 0 2]
[ 8 10]]
[ 0 2 8 10]
,行增加8,列增加2;这反映在B
(4 * 8,4 * 2)跨越。
但是在(32,8)
中,步骤是(2,6,2) - 跨步不能做到这一点。
由此我得出结论,没有副本就不可能重塑。