MATLAB - 将参数传递给pdist自定义距离函数

Question

我已经在Matlab中实现了k-medoids算法的自定义距离函数，遵循pdist中的指示。

基本上它会比较两个向量，比如A和B（也可以有不同的长度）并检查它们的元素是否“与容差共存”：A(i)和{{如果

，则与容差B(j)共同发生

tol

如果没有详细说明，如果“容忍共存”很少，距离就会很大。

如果我将abs( A(i) - B(j) ) <= tol 定义为函数内部的常量，那么一切都按预期工作，但现在我想将它作为参数传递给每当我调用k-medoids时。 pdist文档没有提到这种可能性：

  

使用@指定的距离函数：   D = pdist（X，@ distfun）。   距离函数必须是形式   d2 = distfun（XI，XJ），   取对应于X的单行的1×n向量XI和对应于X的多行的m2-by-n矩阵XJ作为参数.distfun必须接受具有任意行数的矩阵XJ。 distfun必须返回距离d2的m2-by-1向量，其第k个元素是XI和XJ之间的距离（k，:)。

那么，是否有可能以某种方式将参数传递给Matlab中的自定义距离函数？如果没有，我应该考虑哪些替代方案？

Answer 1

要回答您的一般问题，是的，您可以将自定义参数传递给自定义距离函数。你可以用这种方式定义distfun

a = 1; % Variable you want to pass to your function
distanceFunction = @(xi, xj)yourCustomDistanceFunction(xi, xj, a)

yourCustomDistanceFunction应接受默认参数作为前两个输入，然后最后一个输入是您自己的变量（不是pdist传递的）。

然后按以下方式将其提供给pdist

pdist(X, distanceFunction)