ggbiplot图形显示在组中

时间:2016-03-02 20:38:38

标签: r ggplot2 pca ggbiplot

我正在使用wine数据集学习双版画。 R如何知道Barolo,Grignolino和Barbera是wine.class而我们在数据集中没有看到葡萄酒类别列?

有关wine数据集的更多详细信息,请参阅以下链接

ggbiplot - how not to use the feature vectors in the plot

https://github.com/vqv/ggbiplot

非常感谢

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

wine数据集中,您有2个对象,一个data.frame wine,其中有178个观察13个定量变量:

str(wine)
'data.frame':   178 obs. of  13 variables:
 $ Alcohol       : num  14.2 13.2 13.2 14.4 13.2 ...
 $ MalicAcid     : num  1.71 1.78 2.36 1.95 2.59 1.76 1.87 2.15 1.64 1.35 ...
 $ Ash           : num  2.43 2.14 2.67 2.5 2.87 2.45 2.45 2.61 2.17 2.27 ...
 $ AlcAsh        : num  15.6 11.2 18.6 16.8 21 15.2 14.6 17.6 14 16 ...
 $ Mg            : int  127 100 101 113 118 112 96 121 97 98 ...
 $ Phenols       : num  2.8 2.65 2.8 3.85 2.8 3.27 2.5 2.6 2.8 2.98 ...
 $ Flav          : num  3.06 2.76 3.24 3.49 2.69 3.39 2.52 2.51 2.98 3.15 ...
 $ NonFlavPhenols: num  0.28 0.26 0.3 0.24 0.39 0.34 0.3 0.31 0.29 0.22 ...
 $ Proa          : num  2.29 1.28 2.81 2.18 1.82 1.97 1.98 1.25 1.98 1.85 ...
 $ Color         : num  5.64 4.38 5.68 7.8 4.32 6.75 5.25 5.05 5.2 7.22 ...
 $ Hue           : num  1.04 1.05 1.03 0.86 1.04 1.05 1.02 1.06 1.08 1.01 ...
 $ OD            : num  3.92 3.4 3.17 3.45 2.93 2.85 3.58 3.58 2.85 3.55 ...
 $ Proline       : int  1065 1050 1185 1480 735 1450 1290 1295 1045 1045 ...

还有一个vector wine.class包含178个定性wine.class变量的观察结果:

str(wine.class)
 Factor w/ 3 levels "barolo","grignolino",..: 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...

13个定量变量用于计算PCA:

wine.pca <- prcomp(wine, scale. = TRUE)

wine.class变量仅用于为图上的点着色