绘制许多类别

时间:2016-02-29 13:29:32

标签: r statistics methodology

我的数据如下,每个实验都会导致构图的显示,每个构图都属于一个或多个类别。我想绘制每个构图的出现次数:

DF <- read.table(text = " Comp         Category

Comp1             1
Comp2             1   
Comp3             4,2
Comp4             1,3
Comp1             1,2
Comp3             3 ", header = TRUE)

barplot(table(DF$Comp))

所以这对我来说非常合适。

之后,由于作文属于一个或多个类别。在类别之间有逗号分隔。我想在Y中用条形图绘制X中的组合词,在每个条形图中用每个条形图显示每个类别的百分比。

我的想法是复制有逗号的行,所以重复它N + 1逗号的数量。

DF = table(DF$Category,DF$Comp)
cats <- strsplit(rownames(DF), ",", fixed = TRUE)
DF <- DF[rep(seq_len(nrow(DF)), sapply(cats, length)),]
DF <- as.data.frame(unclass(DF))
DF$cat <- unlist(cats)
DF <- aggregate(. ~ cat, DF, FUN = sum)

它会举例说明:对于Comp1

          1     2     3     4
Comp1     2     1     0     0

但如果我应用这种方法,则类别(3)的总数不会对应于作文总数(comp1 = 2)。

如何处理这种情况?解决方案是通过逗号+1的nb吗?如果是,如何在我的代码中执行此操作,是否有最简单的方法?

非常感谢!

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

正如您已经注意到的,制作您的情节需要两个步骤。首先,需要准备数据,然后才能创建情节。

准备数据

您已经展示了将数据转换为合适形式的努力,但让我提出另一种方法。

首先,我必须确保数据框的Category列是一个字符,而不是一个因素。我还存储了数据框中出现的所有类别的向量:

DF$Category <- as.character(DF$Category)
cats <- unique(unlist(strsplit(DF$Category, ",")))

然后我需要总结数据。为此,我需要一个函数,为Comp中的每个值提供缩放的每个类别的百分比,即值的总和给出原始数据中的行数Comp。 / p>

以下函数以另一个数据帧的形式返回整个数据帧的此信息(输出需要是一个数据帧,因为我想稍后使用do()函数。)

cat_perc <- function(cats, vec) {
  # percentages
  nums <- sapply(cats, function(cat) sum(grepl(cat, vec)))
  perc <- nums/sum(nums)
  final <- perc * length(vec)
  df <- as.data.frame(as.list(final))
  names(df) <- cats
  return(df)
}

在完整数据框上运行该函数给出:

cat_perc(cats, DF$Category)
##          1         4        2        3
## 1 2.666667 0.6666667 1.333333 1.333333

这些值总计为6,这实际上是原始数据框中的总行数。

现在我们要为Comp的每个值运行该函数,这可以使用dplyr包来完成:

library(dplyr)
plot_data <-
group_by(DF, Comp) %>%
  do(cat_perc(cats, .$Category))
plot_data
## plot_data
## Source: local data frame [4 x 5]
## Groups: Comp [4]
## 
##     Comp        1         4         2         3
##   (fctr)    (dbl)     (dbl)     (dbl)     (dbl)
## 1  Comp1 1.333333 0.0000000 0.6666667 0.0000000
## 2  Comp2 1.000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
## 3  Comp3 0.000000 0.6666667 0.6666667 0.6666667
## 4  Comp4 0.500000 0.0000000 0.0000000 0.5000000

首先按Comp对数据进行分组,然后将函数cat_perc仅应用于具有给定Comp的数据框的子集。

我将使用ggplot2包绘制数据,这需要数据采用所谓的长格式。这意味着要绘制的每个数据点应对应于数据框中的一行。 (现在,每行包含4个数据点。)这可以使用tidyr包完成,如下所示:

library(tidyr)
plot_data <-  gather(plot_data, Category, value, -Comp)
head(plot_data)
## Source: local data frame [6 x 3]
## Groups: Comp [4]
## 
##     Comp Category    value
##   (fctr)    (chr)    (dbl)
## 1  Comp1        1 1.333333
## 2  Comp2        1 1.000000
## 3  Comp3        1 0.000000
## 4  Comp4        1 0.500000
## 5  Comp1        4 0.000000
## 6  Comp2        4 0.000000

如您所见,现在每行有一个数据点,其特征为CompCategory和相应的value

绘制数据

现在所有内容都已读取,我们可以使用ggplot绘制数据:

library(ggplot2)
ggplot(plot_data, aes(x = Comp, y = value, fill = Category)) +
  geom_bar(stat = "identity")

enter image description here