我需要尽可能高效地计算产品矢量矩阵。具体来说,给定向量s
和矩阵A
,我需要计算s * A
。我有一个Vector
课程,其中包含std::vector
和一个课程Matrix
,它也包含std::vector
(效率)。
天真的方法(我现在正在使用的方法)是有类似
的东西Vector<T> timesMatrix(Matrix<T>& matrix)
{
Vector<unsigned int> result(matrix.columns());
// constructor that does a resize on the underlying std::vector
for(unsigned int i = 0 ; i < vector.size() ; ++i)
{
for(unsigned int j = 0 ; j < matrix.columns() ; ++j)
{
result[j] += (vector[i] * matrix.getElementAt(i, j));
// getElementAt accesses the appropriate entry
// of the underlying std::vector
}
}
return result;
}
工作正常,需要近12000微秒。请注意,向量s
包含499个元素,而A
为499 x 15500
。
下一步是尝试并行化计算:如果我有N
个线程,那么我可以给每个线程一个向量s
的一部分和矩阵的{“对应”行{{1 }}。每个线程将计算一个499大小的A
,最终结果将是它们的入口总和
首先,在类Vector
中,我添加了一个方法来从Matrix
中提取一些行并构建一个较小的行:
Matrix
然后我定义了一个线程例程
Matrix<T> extractSomeRows(unsigned int start, unsigned int end)
{
unsigned int rowsToExtract = end - start + 1;
std::vector<T> tmp;
tmp.reserve(rowsToExtract * numColumns);
for(unsigned int i = start * numColumns ; i < (end+1) * numColumns ; ++i)
{
tmp.push_back(matrix[i]);
}
return Matrix<T>(rowsToExtract, numColumns, tmp);
}
最后我修改了上面显示的void timesMatrixThreadRoutine
(Matrix<T>& matrix, unsigned int start, unsigned int end, Vector<T>& newRow)
{
// newRow is supposed to contain the partial result
// computed by a thread
newRow.resize(matrix.columns());
for(unsigned int i = start ; i < end + 1 ; ++i)
{
for(unsigned int j = 0 ; j < matrix.columns() ; ++j)
{
newRow[j] += vector[i] * matrix.getElementAt(i - start, j);
}
}
}
方法的代码:
timesMatrix
它仍然有效,但现在需要将近30000微秒,这几乎是以前的三倍。
我做错了吗?你认为有更好的方法吗?
Vector<T> timesMatrix(Matrix<T>& matrix)
{
static const unsigned int NUM_THREADS = 4;
unsigned int matRows = matrix.rows();
unsigned int matColumns = matrix.columns();
unsigned int rowsEachThread = vector.size()/NUM_THREADS;
std::thread threads[NUM_THREADS];
Vector<T> tmp[NUM_THREADS];
unsigned int start, end;
// all but the last thread
for(unsigned int i = 0 ; i < NUM_THREADS - 1 ; ++i)
{
start = i*rowsEachThread;
end = (i+1)*rowsEachThread - 1;
threads[i] = std::thread(&Vector<T>::timesMatrixThreadRoutine, this,
matrix.extractSomeRows(start, end), start, end, std::ref(tmp[i]));
}
// last thread
start = (NUM_THREADS-1)*rowsEachThread;
end = matRows - 1;
threads[NUM_THREADS - 1] = std::thread(&Vector<T>::timesMatrixThreadRoutine, this,
matrix.extractSomeRows(start, end), start, end, std::ref(tmp[NUM_THREADS-1]));
for(unsigned int i = 0 ; i < NUM_THREADS ; ++i)
{
threads[i].join();
}
Vector<unsigned int> result(matColumns);
for(unsigned int i = 0 ; i < NUM_THREADS ; ++i)
{
result = result + tmp[i]; // the operator+ is overloaded
}
return result;
}
根据Ilya Ovodov的建议,我定义了一个包含VirtualMatrix
的类VirtualMatrix
,它在构造函数中初始化为
T* matrixData
然后有一种方法来检索矩阵的特定条目:
VirtualMatrix(Matrix<T>& m)
{
numRows = m.rows();
numColumns = m.columns();
matrixData = m.pointerToData();
// pointerToData() returns underlyingVector.data();
}
现在执行时间更好(大约8000微秒),但也许有一些改进。特别是线程例程现在是
inline T getElementAt(unsigned int row, unsigned int column)
{
return *(matrixData + row*numColumns + column);
}
并且真正缓慢的部分是具有嵌套void timesMatrixThreadRoutine
(VirtualMatrix<T>& matrix, unsigned int startRow, unsigned int endRow, Vector<T>& newRow)
{
unsigned int matColumns = matrix.columns();
newRow.resize(matColumns);
for(unsigned int i = startRow ; i < endRow + 1 ; ++i)
{
for(unsigned int j = 0 ; j < matColumns ; ++j)
{
newRow[j] += (vector[i] * matrix.getElementAt(i, j));
}
}
}
循环的部分。如果我删除它,结果显然是错误的,但在不到500微秒内“计算”。这就是说现在传递参数几乎没有时间,重要的部分实际上是计算。
根据你的意见,有没有办法让它更快?
答案 0 :(得分:2)
实际上,您为extractSomeRows中的每个线程制作了矩阵的部分副本。这需要很多时间。 重新设计它,使“某些行”成为虚拟矩阵,指向位于原始矩阵中的数据。
答案 1 :(得分:1)
使用矢量化汇编指令用于体系结构,使其更明确,您希望以4为乘,即x86-64 SSE2 +和可能ARM'S NEON。
如果你明确地在偶然元素中进行操作,C ++编译器通常可以将循环展开为向量化代码:
Simple and fast matrix-vector multiplication in C / C++
还可以选择使用专门用于矩阵乘法的库。对于较大的矩阵,使用基于快速傅立叶变换的特殊实现,Strassen算法等替代算法可能更有效。事实上,最好的办法是使用这样的C库,然后将其包装在看起来类似于C ++向量的接口。