从csv的Python图形

Question

我提取了6个月的电子邮件元数据并将其保存为csv文件。 csv现在只包含两列（来自和来自电子邮件地址）。我想构建一个图形，其中顶点是我与之通信的人以及与我通信的那些顶点，边缘是通过通信链接创建的，通过链接标记我有多少通信。解决这个问题的最佳方法是什么？

Answer 1

一种方法是使用关联数据原则（如果您的时间不够并且没有关联数据的背景，则不建议使用）。这是一种可能的方法：

1. 将每个实体描述为URI
2. 使用现有本体（例如foaf）来描述数据
3. 将数据转换为资源描述框架（RDF）
4. 使用RDF可视化工具。

由于RDF本质上是一个图表，您将能够可视化您的数据并扩展它。

如果您不熟悉关联数据，查看加密的方法是使用Pajek（http://vlado.fmf.uni-lj.si/pub/networks/pajek/）。这种方法更简单，但缺乏语义互操作性的好处，只要您首先关心它们。

Answer 2

Cytoscape可能能够以该格式导入您的数据并从中构建网络。

http://www.cytoscape.org/

Answer 3

你的问题（虽然提到Python）没有说明你想用Python做什么部分或多少。我将假设Python是您知道的工具，但主要目标是使数据可视化。在那种情况下：

1）使用Gephi network analysis tool - 有些工具可以按原样使用您的CSV文件，而Gephi就是其中之一。在你的情况下，需要保留边缘权重（=用2个电子邮件地址交换的电子邮件数量），这可以使用"mixed" variation of Gephi's CSV format来完成。

2）另一种选择是预处理您的CSV文件（例如使用Python），计算边缘权重（每2个电子邮件地址之间的电子邮件数量）并以您喜欢的任何格式保存。结果可以在网络分析工具（如Gephi）中直观显示，也可以直接在Python中显示（例如使用https://graph-tool.skewed.de）。

以下是email network analysis project的示例（尽管他们的图表没有显示权重）。