使用Fuseki,TDB和命名图进行推理?

时间:2016-02-16 09:04:23

标签: jena fuseki reasoning tdb named-graphs

我正在为Fuseki 2中的TDB数据集提供包含10-20个命名图的数据集。 我想使用推理器来推断我的数据。我希望看到的行为是每个图形中推断出的三元组应该出现在这些图形中(尽管如果三元组也出现在默认图形中也没问题)。 有一种简单的配置方法吗?我还没有找到符合我要做的配置示例。

我尝试的配置与以下标准示例非常相似。

DatasetTDB - > GraphTDB - > InfModel - > RDFDataset

我看到的数据的最终视图只是数据的一个非常小的子集(似乎所有命名的图形都沿着这个管道被丢弃,只剩下很小的默认图形)。 使用tdb:unionDefaultGraph似乎对此没有影响。

prefix :        <#> .
@prefix fuseki:  <http://jena.apache.org/fuseki#> .
@prefix rdf:     <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#> .

@prefix rdfs:    <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#> .
@prefix tdb:     <http://jena.hpl.hp.com/2008/tdb#> .
@prefix ja:      <http://jena.hpl.hp.com/2005/11/Assembler#> .

# Example of a data service with SPARQL query and update on an 
# inference model.  Data is taken from TDB.

## ---------------------------------------------------------------
## Service with only SPARQL query on an inference model.
## Inference model base data is in TDB.

<#service2>  rdf:type fuseki:Service ;
fuseki:name              "inf" ;             # http://host/inf
fuseki:serviceQuery      "sparql" ;          # SPARQL query service
fuseki:serviceUpdate     "update" ;
fuseki:dataset           <#dataset> ;
.

<#dataset> rdf:type       ja:RDFDataset ;
ja:defaultGraph       <#model_inf> ;
 .

<#model_inf> a ja:InfModel ;
 ja:baseModel <#tdbGraph> ;
 ja:reasoner [
     ja:reasonerURL <http://jena.hpl.hp.com/2003/OWLFBRuleReasoner>
 ] .

## Base data in TDB.
<#tdbDataset> rdf:type tdb:DatasetTDB ;
tdb:location "DB" ;
# If the unionDefaultGraph is used, then the "update" service should be removed.
# tdb:unionDefaultGraph true ;
.

<#tdbGraph> rdf:type tdb:GraphTDB ;
tdb:dataset <#tdbDataset> .
</code>

有没有人对此有任何想法?

此外,如果有办法使数据集可写,则可获得奖励积分。 (在某种程度上,我尝试做的是接近Owlim / GraphDB的默认行为,它保持持久的命名图,进行推理,并允许更新。)

提前致谢。

3 个答案:

答案 0 :(得分:1)

我在代码上面临(或面临)同样的问题,但我有一个部分解决方案。不幸的是,评论中提供的链接并没有真正帮助我仍然面临的问题,但这回答了部分问题。

  

我看到的数据的最终视图只是其中的一小部分   数据(似乎所有命名的图形都被丢弃了   这个管道,只留下微小的默认图表)。运用   tdb:unionDefaultGraph似乎对此没有影响。

我找到的解决方法是在配置文件中明确“注册”您的命名图。我真的不知道它是否是最好的方式(并没有找到任何文档或示例的确切上下文)。我的设置上的一个工作示例(Fuseki 2.4):

[usual configuration start]

# TDB Dataset
:tdb_dataset_readwrite
        a             tdb:DatasetTDB ;
        tdb:unionDefaultGraph true ; 
        #if you want all data to available in the default graph
        #without 'FROM-NAMing them' in the SPARQL query
        tdb:location  "your/dataset/path" .

# Underlying RDF Dataset
<#dataset> 
    rdf:type    ja:RDFDataset ;
    ja:defaultGraph <#model> ;
    ja:namedGraph [
        ja:graphName    <your/graph/URI> ;
        ja:graph        <#graphVar> 
    ] ;

    [repeat for other named graphs]
    .      


######
# Default Model : Inference rules (OWL, here)
<#model> a ja:InfModel;
    ja:baseModel <#tdbGraph>;
    ja:reasoner
    [ ja:reasonerURL 
        <http://jena.hpl.hp.com/2003/OWLFBRuleReasoner>
    ]
    .

# Graph for the default Model
<#tdbGraph> rdf:type tdb:GraphTDB;
    tdb:dataset :tdb_dataset_readwrite .

######
# Named Graph
<#graphVar> rdf:type tdb:GraphTDB ;
    tdb:dataset :tdb_dataset_readwrite ;
    tdb:graphName <your/graph/URI> 
    .

然后,您可以运行像这样的查询

[prefixes]

SELECT ?graph ?predicate ?object
WHERE {
  GRAPH ?graph {[a specific entity identifier] ?predicate ?object}
}
LIMIT 50

它将显示(在本例中)属性和值,以及显示它们的源图。

但是:在这个例子中,即使默认图表被认为是导入的推理规则(应该全局应用,特别是因为启用了unionDefaultGraph参数),它们不会以“交叉图”的方式应用,即我仍然面临的问题。

通常情况下,如果你将推理引擎添加到每个图表中,根据Andy Seaborne的帖子here,这应该可行,但它在我的情况下不起作用。

希望这会有所帮助。

答案 1 :(得分:1)

我自己多次遇到过这个问题,但我实际上从未见过这样的解决方案。但是,在阅读了有关&#34;特殊图形名称&#34;的文档中的this之后,我设法弄明白了。在TDB数据集中。据我所知,在汇编程序文件中为TDB数据集设置联合默认图只会更改查询该特定数据集时返回的内容。但是,有一个特殊的图形名称可用于引用联合图形:<urn:x-arq:UnionGraph>。因此,只需创建GraphTDB,引用TDB数据集并将其指向此特殊图表。

下面的配置文件执行问题中请求的内容:在默认联合图上执行推理,结果在TDB数据集中作为可写服务公开。 (请注意,推理服务在重新加载之前不会看到数据集中的任何更改,因为推理都是在内存中完成的。)

@prefix :      <http://base/#> .
@prefix tdb:   <http://jena.hpl.hp.com/2008/tdb#> .
@prefix rdf:   <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#> .
@prefix ja:    <http://jena.hpl.hp.com/2005/11/Assembler#> .
@prefix rdfs:  <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#> .
@prefix fuseki: <http://jena.apache.org/fuseki#> .

# TDB
tdb:DatasetTDB  rdfs:subClassOf  ja:RDFDataset .
tdb:GraphTDB    rdfs:subClassOf  ja:Model .


# Service 1: Dataset endpoint (no reasoning)
:dataService a fuseki:Service ;
  fuseki:name           "tdbEnpoint" ;
  fuseki:serviceQuery   "sparql", "query" ;
  fuseki:serviceUpdate  "update" ;
  fuseki:dataset        :tdbDataset ;
.

# Service 2: Reasoning endpoint
:reasoningService a fuseki:Service ;
  fuseki:dataset                 :infDataset ;
  fuseki:name                    "reasoningEndpoint" ;
  fuseki:serviceQuery            "query", "sparql" ;
  fuseki:serviceReadGraphStore   "get" ;
.

# Inference dataset
:infDataset rdf:type ja:RDFDataset ;
            ja:defaultGraph :infModel ;
.

# Inference model
:infModel a ja:InfModel ;
           ja:baseModel :g ;

           ja:reasoner [
              ja:reasonerURL <http://jena.hpl.hp.com/2003/OWLFBRuleReasoner> ;
           ] ;
.

# Intermediate graph referencing the default union graph
:g rdf:type tdb:GraphTDB ;
   tdb:dataset :tdbDataset ;
   tdb:graphName <urn:x-arq:UnionGraph> ;
.

# The location of the TDB dataset
:tdbDataset rdf:type tdb:DatasetTDB ;
            tdb:location "/fuseki/databases/db" ;
            tdb:unionDefaultGraph true ; 
.

答案 2 :(得分:0)

我使用类似的配置,并且当我尝试在Web UI中添加命名图时,出现错误

Result: failed with message "Read-only object file"

有人遇到这样的错误吗? 我已经检查了所有777中的DatasetTDB位置事件集中的所有permissins,但是仍然有相同的错误。 如果我上传默认图文件,一切正常。