我尝试了新的" pivot" larger stacked dataset上的1.6函数。它有5,656,458行,IndicatorCode
列有1344个不同的代码。
我的想法是使用数据转移到"取消堆栈" (在pandas术语中)这个数据集并且每个IndicatorCode都有一列。
schema = StructType([ \
StructField("CountryName", StringType(), True), \
StructField("CountryCode", StringType(), True), \
StructField("IndicatorName", StringType(), True), \
StructField("IndicatorCode", StringType(), True), \
StructField("Year", IntegerType(), True), \
StructField("Value", DoubleType(), True) \
])
data = sqlContext.read.load('hdfs://localhost:9000/tmp/world-development-indicators/Indicators.csv',
format='com.databricks.spark.csv',
header='true',
schema=schema)
data2 = indicators_csv.withColumn("IndicatorCode2", regexp_replace("indicatorCode", "\.", "_"))\
.select(["CountryCode", "IndicatorCode2", "Year", "Value"])
columns = [row.IndicatorCode2 for row in data2.select("IndicatorCode2").distinct().collect()]
data3 = data2.groupBy(["Year", "CountryCode"])\
.pivot("IndicatorCode2", columns)\
.max("Value")
成功返回后,data3.first()
从未返回结果(我在10分钟后使用3个核心在我的独立中断)。
我使用RDD
和aggregateByKey
的方法运行良好,因此我没有搜索有关如何执行此操作的解决方案,但是使用DataFrames的数据透视是否也能解决问题。
答案 0 :(得分:3)
嗯,一般来说,旋转不是一种非常有效的操作,使用DataFrame
API可以做很多事情。您可以尝试的一件事是repartition
您的数据:
(data2
.repartition("Year", "CountryCode")
.groupBy("Year", "CountryCode")
.pivot("IndicatorCode2", columns)
.max("Value"))
甚至聚合:
from pyspark.sql.functions import max
(df
.groupBy("Year", "CountryCode", "IndicatorCode")
.agg(max("Value").alias("Value"))
.groupBy("Year", "CountryCode")
.pivot("IndicatorCode", columns)
.max("Value"))
在应用pivot
之前。两种解决方案背后的想法是一样的。而不是移动大的扩展Rows
移动狭窄的密集数据并在本地扩展。
答案 1 :(得分:1)
Spark 2.0引入了SPARK-13749一个pivot的实现,对于大量的pivot列值更快。
在我的计算机上使用Spark 2.1.0进行测试,您的示例现在可以在48秒内运行。