在MATLAB代码中,我使用的kullback_leibler_divergence
相异度函数可以找到here。
我有一个矩阵A
,我使用下载的函数计算相异度矩阵。
理论上,如果我计算
clear
A = rand(132,6); % input matrix
diss_mat = pdist(A,'@kullback_leibler_divergence'); % calculate the dissimilarity
square_diss_mat = squareform(diss_mat); % I put the dissimilarities in a square matrix
one_dist = pdist2(A(1,:),A,@kullback_leibler_divergence);
我应该让square_diss_mat
的第一行等于one_dist
,但我不是。
如果我使用欧几里德距离我得到它:
diss_mat = pdist(A);
square_diss_mat = squareform(diss_mat);
one_dist = pdist2(A(1,:),A);
你能告诉我为什么吗?
答案 0 :(得分:1)
kullback_leibler_divergence
不对称,因此顺序很重要:
one_dist = pdist2(A, A(1,:), @kullback_leibler_divergence);
我没有看到任何使用pdist
或pdist2
的非对称函数的实际应用。