合并具有相似子字符串的文件

Question

我想合并共享类似文件名开头的配对文件。输出应该是在相应输入文件中找到的唯一名称。 我不知道怎么做，但cat会以某种方式做。

107_MAE_E7_S11_L001_R1_001.fastq.gz
107_MAE_E7_S11_L002_R1_001.fastq.gz
108_IME_A8_S23_L001_R1_001.fastq.gz
108_IME_A8_S23_L002_R1_001.fastq.gz

out

107_MAE_E7_S11.fastq.gz
108_IME_A8_S23.fastq.gz

Answer 1

从您的示例（如果它代表所有文件名不清楚），您可以剪切文件的中间部分，并使用uniq。你的关键取决于所有文件是否真的像你上面的那样。

示例：

# cut -c1-14,27- myfilename | uniq
107_MAE_E7_S11.fastq.gz
108_IME_A8_S23.fastq.gz