我跟随Rqc package documentation，所以我输入了以下内容：
library(Rqc)
folder <- system.file(package="ShortRead", "extdata/E-MTAB-1147")
rqc(path = folder, pattern = ".fastq.gz")
但我收到以下错误：
位图错误（file = filename，width = width，height = height，res = 300）：找不到GhostScript
答案 0 :(得分：3)
我正在运行最新版本的RStudio（0.99.491）。首先，确保已下载GhostScript（here）。然后，转到安装它的目录，找到可执行文件的路径。然后，这样做：
Sys.setenv(R_GSCMD="C:/Program Files/gs/gs9.18/bin/gswin64c.exe")
路径指的是我特定的.exe，所以你的可能会有所不同。基本上，抛出错误的函数正在寻找R_GSCMD来为它提供运行GhostScript的路径。它找不到一个，所以它抛出了一个错误。通过将R_GSCMD设置为路径，它现在知道要查找的位置。