R循环 - 是否有更有效的方法?

时间:2016-02-01 00:00:16

标签: r loops for-loop nested-loops

我有一个数据框,每行都有一个唯一的ID。我需要根据开始日期和结束日期的最大值以及批准日期之间的天数来复制这些行中的每一行。

ID <- c(1,2)

Value <- c(10,20)

StartDate <- c(as.Date("01/01/2015", '%d/%m/%Y'),
    as.Date("01/01/2015", '%d/%m/%Y'))

EndDate <- c(as.Date("31/01/2015", '%d/%m/%Y'), 
    as.Date("15/01/2015", '%d/%m/%Y'))

AppDate <- c(as.Date("15/01/2015", '%d/%m/%Y'), 
    as.Date("15/02/2015", '%d/%m/%Y'))

df <- data.frame(ID, Value, StartDate, EndDate, AppDate)

df <- df[rep(row.names(df), ifelse(as.numeric(df$AppDate) >
    as.numeric(df$EndDate),as.numeric(df$AppDate-df$StartDate),
    as.numeric(df$EndDate-df$StartDate)) + 1),]

然后,我需要添加从开始日期到结束日期或批准日期的最大日期的顺序日期列表。

我通过2个循环完成了这个。外部循环遍历每个唯一ID的数据帧。然后第二个循环遍历ID并添加日期。第二个循环完成后,它会将行作为新的起始点传递给外循环。

IDs <- unique(df$ID)
df$Days <- rep(as.Date("01/01/1999",'%d/%m/%Y'), nrow(df))
counter <- 1
for (i in 1:length(IDs)) {
    ref <- IDs[i]
    start <- 1
        while (df$ID[counter] == ref) {
            ifelse(start == 1, df$Days[counter] <- df$StartDate[counter],
                df$Days[counter] <- df$StartDate[counter] + start -1)
            ifelse (counter > nrow(df), break, counter <- counter + 1)
            ifelse (counter > nrow(df), break, start <- start + 1)
        }
 }

我的实际数据集有超过6,000个ID,一旦我复制了行,它最终会超过500,000行。循环花费了15分钟来运行所以它显然非常低效。

所以我猜我有两个问题。

1)。在R

中执行此操作的最有效方法是什么

2)。一般来说最有效的方法是什么,比如像C ++这样的东西

感谢

2 个答案:

答案 0 :(得分:0)

这是一个矢量化的解决方案。注意:您的代码与我尝试执行的最大EndDate和AppDate的概念不符,但如果这不是您想要的,则可以相应地修改代码。

library(dplyr)
df <- df %>% group_by(ID) %>% mutate(Days = rep(seq(min(StartDate), max(EndDate, df$AppDate), 'days'), ceiling(nrow(df) / n()))[1:n()])

输出如下(仅前几行):

head(df)
Source: local data frame [6 x 6]
Groups: ID [1]

     ID Value  StartDate    EndDate    AppDate       Days
  (dbl) (dbl)     (date)     (date)     (date)     (date)
1     1    10 2015-01-01 2015-01-31 2015-01-15 2015-01-01
2     1    10 2015-01-01 2015-01-31 2015-01-15 2015-01-02
3     1    10 2015-01-01 2015-01-31 2015-01-15 2015-01-03
4     1    10 2015-01-01 2015-01-31 2015-01-15 2015-01-04
5     1    10 2015-01-01 2015-01-31 2015-01-15 2015-01-05
6     1    10 2015-01-01 2015-01-31 2015-01-15 2015-01-06

tail(df)
Source: local data frame [6 x 6]
Groups: ID [1]

     ID Value  StartDate    EndDate    AppDate       Days
  (dbl) (dbl)     (date)     (date)     (date)     (date)
1     2    20 2015-01-01 2015-01-15 2015-02-15 2015-02-10
2     2    20 2015-01-01 2015-01-15 2015-02-15 2015-02-11
3     2    20 2015-01-01 2015-01-15 2015-02-15 2015-02-12
4     2    20 2015-01-01 2015-01-15 2015-02-15 2015-02-13
5     2    20 2015-01-01 2015-01-15 2015-02-15 2015-02-14
6     2    20 2015-01-01 2015-01-15 2015-02-15 2015-02-15

答案 1 :(得分:0)

通常,我建议使用交叉连接SQL查询返回笛卡尔积(两组之间的所有组合)。但是,您可以使用merge()复制R中的交叉联接,而不使用任何by参数和all=True。从那里,过滤EndDate截止:

# CALCULATE CONDITIONAL END DATE
df$TrueEndDate <- as.Date(ifelse(df$AppDate > df$EndDate,
                                 df$AppDate,
                                 df$EndDate), origin="1970-01-01")

# CREATE A SEQUENTIAL DATES DATA FRAME (HERE IS 60 DAYS FROM 2015-01-01)
dates <- data.frame(Date=as.Date(unlist(lapply(0:60, function(x) 
                                      as.Date("2015-01-01") + x)),                    
                                 origin="1970-01-01"))   

# RUN CROSS JOIN MERGE, PULLING ONLY NEEDED FIELDS
mergedf <- merge(df[c('ID', 'StartDate', 'TrueEndDate')], dates, all=TRUE)

# FILTER OUT DATES PAST ROW'S TRUE END DATE
mergedf <- mergedf[(mergedf$Date <= mergedf$TrueEndDate),]

# CLEANUP
mergedf <- mergedf[with(mergedf, order(ID)), ]     # ORDER BY ID
row.names(mergedf) <- 1:nrow(mergedf)              # RESET ROW NAMES

您是否对等效的交叉连接SQL感兴趣(您可以在RDMS引擎上调用R并将其作为最终数据框导入,可能有助于解决性能问题):

SELECT ID.ID, ID.Value, ID.StartDate, 
       CASE WHEN ID.AppDate > ID.EndDate 
            THEN ID.AppDate 
            ELSE ID.EndDate 
       END As TrueEndDate, 
Dates.Dates
FROM ID, Dates
WHERE  Dates.Dates <= CASE WHEN ID.AppDate > ID.EndDate 
                           THEN ID.AppDate ELSE ID.EndDate 
                      END
ORDER BY ID.ID, Dates.Dates