根据公式规范化R中的列

时间:2016-01-24 09:38:52

标签: r regression normalization bioinformatics

假设我有一个1000行和3列的数据帧(列t0,t4和t8)。 每列代表一个时间点(0小时,4小时和8小时)。 数据是基因表达式:numeric(float):

row.name                t0      t4      t8
ENSG00000000419.8       1780.00 1837.00 1011.00
ENSG00000000457.9       859.00  348.39  179.00
ENSG00000000460.12      1333.00 899.00  508.00

我需要根据已知结果对数据进行标准化。 我知道所有行(基因)的平均半衰期应为10小时。 所以我需要找到平均半衰期为10小时的t4和t8的系数。 每行的半衰期由公式计算:

半衰期= 16 /( - 2 * log2(t4 / t0)-log2(t8 / t0))

你原则上可以说问题是如何在给定已知均值Y,已知公式和第一列(1)的已知系数的情况下找到3列中的2列的系数? (我不是数学家/统计学家)

这是一种回归问题,不是吗?

0 个答案:

没有答案