如何用Node.js解析脏CSV?

时间:2016-01-23 13:05:36

标签: javascript node.js parsing csv

我在CSV文件上摸不着头脑,由于很多错误,我无法正确解析。我提取了一个样本,您可以在此处下载:Test CSV File

主要错误(或产生错误的原因)是:

  • 行情&逗号(尝试用R解析文件时出现很多错误)
  • 空行
  • 字段内的意外换行

我首先决定逐行使用正则表达式来清理数据,然后再将它们加载到R中,但无法解决问题,这是两个慢(200Mo文件)

所以我决定在Node.js下使用CSV parser,代码如下:

'use strict';

const Fs  = require('fs');
const Csv = require('csv');

let input       = 'data_stack.csv';
let readStream  = Fs.createReadStream(input);
let option      = {delimiter: ',', quote: '"', escape: '"', relax: true};

let parser = Csv.parse(option).on('data', (data) => {
    console.log(data)
});

readStream.pipe(parser)

可是:

  • 正确解析某些行(字符串数组)
  • 有些未解析(所有字段都是一个字符串)
  • 有些行仍为空(可以通过向选项添加skip_empty_lines: true来解决)
  • 我不知道如何处理意外的换行符。

我不知道如何使这个CSV干净,无论是R还是Node.js。

任何帮助?

修改

遵循@Danny_ds解决方案,我可以正确解析它。现在我无法正确地将其串回来。

console.log(); 我得到了一个合适的对象但是当我尝试对其进行字符串化时,我没有获得干净的CSV(仍然有换行符并且空行)。

以下是我使用的代码:

'use strict';

const Fs  = require('fs');
const Csv = require('csv');


let input  = 'data_stack.csv';
let output = 'data_output.csv';

let readStream  = Fs.createReadStream(input);
let writeStream = Fs.createWriteStream(output);

let opt  = {delimiter: ',', quote: '"', escape: '"', relax: true, skip_empty_lines: true};


let transformer = Csv.transform(data => {
    let dirty = data.toString();
    let replace = dirty.replace(/\r\n"/g, '\r\n').replace(/"\r\n/g, '\r\n').replace(/""/g, '"');

    return replace;
});

let parser = Csv.parse(opt);
let stringifier = Csv.stringify();

readStream.pipe(transformer).pipe(parser).pipe(stringifier).pipe(writeStream);

编辑2:

以下是最终的代码:

'use strict';

const Fs  = require('fs');
const Csv = require('csv');


let input  = 'data_stack.csv';
let output = 'data_output.csv';

let readStream  = Fs.createReadStream(input);
let writeStream = Fs.createWriteStream(output);

let opt  = {delimiter: ',', quote: '"', escape: '"', relax: true, skip_empty_lines: true};


let transformer = Csv.transform(data => {
    let dirty = data.toString();
    let replace = dirty
        .replace(/\r\n"/g, '\r\n')
        .replace(/"\r\n/g, '\r\n')
        .replace(/""/g, '"');

    return replace;
});

let parser = Csv.parse(opt);

let cleaner = Csv.transform(data => {
    let clean = data.map(l => {
        if (l.length > 100 || l[0] === '+') {
            return l = "Encoding issue";
        }
        return l;
    });
    return clean;
});

let stringifier = Csv.stringify();

readStream.pipe(transformer).pipe(parser).pipe(cleaner).pipe(stringifier).pipe(writeStream);

感谢大家!

3 个答案:

答案 0 :(得分:1)

数据并不太混乱。有一个明确的模式。

一般步骤:

  1. 暂时删除混合格式的内部字段(以双(或更多)引号开头并具有各种字符。
  2. 从引用行的开头和结尾删除引号,以提供干净的CSV
  3. 将数据拆分为列
  4. 替换已删除的字段
  5. 上面的第1步是最重要的。如果你应用它,那么新行,空行,引号和逗号的问题就会消失。如果查看数据,可以看到第7,8和9列包含混合数据。但始终以2引号或更多分隔。 e.g。

    good,clean,data,here,"""<-BEGINNING OF FIELD DATA> Oh no
    ++\n\n<br/>whats happening,, in here, pages of chinese
    characters etc END OF FIELD ->""",more,clean,data
    

    以下是基于提供的文件的工作示例:

    fs.readFile('./data_stack.csv', (e, data) => {
    
        // Take out fields that are delimited with double+ quotes
        var dirty = data.toString();
        var matches = dirty.match(/""[\s\S]*?""/g);
        matches.forEach((m,i) => {
            dirty = dirty.replace(m, "<REPL-" + i + ">");
        });
    
        var cleanData =   dirty
            .split('\n') // get lines
    
            // ignore first line with column names
            .filter((l, i) => i > 0)
    
            // remove first and last quotation mark if exists
            .map(l => l[0] === '"' ? l.substring(1, l.length-2) : l) // remove quotes from quoted lines
    
            // split into columns
            .map(l => l.split(','))
    
            // return replaced fields back to data (columsn 7,8 and 9)
            .map(col => {
    
                if (col.length > 9) {
                    col[7] = returnField(col[7]);
                    col[8] = returnField(col[8]);
                    col[9] = returnField(col[9]);
                }
                return col;
    
                function returnField(f) {
                    if (f) {
                        var repls = f.match(/<.*?>/g)
                        if (repls)
                            repls.forEach(m => {
                                var num = +m.split('-')[1].split('>')[0];
                                f = f.replace(m, matches[num]);
                            });
                    }
                    return f;
                }
            })
    
        return cleanData
    });
    

    结果:

    数据看起来很干净。所有行都产生与标题匹配的预期列数(显示的最后2行):

      ...,
      [ '19403',
        '560e348d2adaffa66f72bfc9',
        'done',
        '276',
        '2015-10-02T07:38:53.172Z',
        '20151002',
        '560e31f69cd6d5059668ee16',
        '""560e336ef3214201030bf7b5""',
        'a+�a��a+�a+�a��a+�a��a+�a��',
        '',
        '560e2e362adaffa66f72bd99',
        '55f8f041b971644d7d861502',
        'foo',
        'foo',
        'foo@bar.com',
        'bar.com' ],
      [ '20388',
        '560ce1a467cf15ab2cf03482',
        'update',
        '231',
        '2015-10-01T07:32:52.077Z',
        '20151001',
        '560ce1387494620118c1617a',
        '""""""Final test, with a comma""""""',
        '',
        '',
        '55e6dff9b45b14570417a908',
        '55e6e00fb45b14570417a92f',
        'foo',
        'foo',
        'foo@bar.com',
        'bar.com' ],
    

答案 1 :(得分:1)

  

我不知道如何使这个CSV干净,既不用R也不用   Node.js的。

实际上,它并没有看起来那么糟糕。

使用以下步骤可以轻松地将此文件转换为有效的csv:

  • 将所有""替换为"
  • 将所有\n"替换为\n
  • 将所有"\n替换为\n

\n表示换行符,而不是字符&#34; \n&#34;它也出现在你的文件中。

请注意,在您的示例文件中,\n实际上是\r\n0x0d0x0a),因此根据您使用的软件,您可能需要替换{{1在上面示例中的\n中。此外,在您的示例中,在最后一行之后有一个换行符,因此作为最后一个字符的引号也将被替换,但您可能希望在原始文件中检查它。

这应该产生一个有效的csv文件:

enter image description here enter image description here

仍然会有多行字段,但这可能是有意的。但现在这些都被正确引用,任何体面的csv解析器都应该能够处理多行字段。

看起来原始数据有一个额外的传递来转义引号字符:

  • 如果原始字段包含\r\n,则会引用它们,如果这些字段已包含引号,则引号会使用其他引号进行转义 - 这是正确的方法。

    < / LI>
  • 但是所有包含引号的行似乎都被引用了(实际上将这些行转换为一个引用的字段),并且该行中的所有引号都使用另一个引号进行了转义。

  • 显然,多行字段出了问题。在多行之间也添加了引号,这不是正确的方法。

答案 2 :(得分:0)

继续发表评论:

数据太乱了,无法一步到位,不要尝试。

首先确定双引号和/或逗号是否可能是数据的一部分。如果不是,请使用简单的正则表达式删除双引号。

接下来,每行应该有14个逗号。将文件作为文本读取,并依次计算每行的逗号数。如果小于14,请检查以下行,如果逗号之和为14,则合并2行。如果总和小于14,请检查下一行并继续,直到您有14个逗号。如果下一行超过14,则会出现严重错误,请记下行号 - 您可能需要手动修复。保存生成的文件。

幸运的是,您现在将拥有一个可以作为CSV处理的文件。如果没有,请返回部分整理的文件,我们可以尝试进一步提供帮助。

不用说你应该处理原件的副本,你不可能第一次就把它弄好:)